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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Tinker力场参数单位
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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] Tinker力场参数单位

请问Tinker力场参数单位的单位是什么？包括bond strech, angle, improper, proper的力常数。谢谢！
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奋斗中的小木虫
1楼 2012-08-03 23:56:35
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mengsk

金虫 (著名写手)
Tinker的manual查了半天也没找到，看文献中的输入文件，对比amber的各项参数，感觉是这样的：
bond:     kcal/mol/A**2
angle:     kcal/mol/radian**2
dihedral:  kcal/mol
improper: kcal/mol
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奋斗中的小木虫
3楼2012-08-05 11:58:10
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, thank you 2012-08-04 14:47:28
mengsk: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢！ 2012-08-05 11:55:42
每一项的最后计算结果都是kcal/mol
根据势函数公式做个反推就出来了
比如Bond stretching: Ebond=k(r-r0)^2
那就是说k的单位=kcal/mol / (A^2)
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2楼2012-08-04 14:11:12
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