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量化新手

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[求助] Rg(x) vs time ,Rg(y) vs time,Rg(z) vs time

我给以国外的专家发了邮件，求的是回旋半径在xyz方向的变化，还有创腾讨论社区也有这个帖子，不晓得咋回事就是回复不了帖子，神贴在此https://community.accelrys.com/message/9323#9323
但这个帖子里面只有整体的回旋半径，我想分出方向来，求大神懂MS里面perl script的帮帮忙，求修改一下，另外请教一下为啥子创腾社区的帖子咋回哦

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1楼 2012-08-03 09:37:45

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引用回帖:

6楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-03 15:27:30
回转半径不就是各原子到质心的均方根距离吗
计算距离的时候拆解成xyz方向上的距离不就是了...

主要是我不懂perl语言啊，而且这里面也基本没有源程序
求大神帮忙改改script：

my $doc = $Documents{"my_trajectory.xtd"};

my $atoms = $doc->UnitCell->Sets("polymer"

->Atoms;

my $axes = $doc->CreatePrincipalAxes($atoms);

my $mass;

foreach my $atom (@$atoms)

{ $mass += $atom->Mass; }

my $trj = $doc->Trajectory;

for (my $i = 1; $i <= $trj->NumFrames; $i++)

{ $trj->CurrentFrame = $i;

my $time = $trj->FrameTime;

my $trace = $axes->PrincipalMoment1

+$axes->PrincipalMoment2

+$axes->PrincipalMoment3;

my $Rg = sqrt($trace*0.5/$mass);

printf "%g %g\n", $time, $Rg; }