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[求助]
想做一些卟啉的模拟计算，请做过类似工作的大侠帮忙报一下你们电脑的配置
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| 主要是做卟啉分子的模拟计算，构型优化，频率计算，光谱计算等。可能未来还会接合到二氧化钛和考虑溶剂效应做进一步的计算。目前卟啉分子大概200~300个原子左右，里面有不少苯环的结构和长烷氧基链。在初始构型还行的情况下，希望在linux环境下的g09软件包下能够两三天算完，最长也不能超过一周的时间，请大家提一个电脑配置方案，特别是做过类似计算工作的大侠报一下你们电脑的配置。请大家积极发帖，谢谢大家！ |
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zhou2009: 金币+3 2012-07-31 09:39:04
zhou2009: 金币+5, 代LZ发 2012-07-31 14:21:41
zhou2009: 金币+3 2012-07-31 09:39:04
zhou2009: 金币+5, 代LZ发 2012-07-31 14:21:41
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我最近也在算卟啉，不过体系比你的小多了，只是计算卟吩与金属的配位，原子数总共也不过40个左右。 用GAMESS US进行的计算，初始构型都是从蛋白质数据库里扣出来的，用60个CPU大概十几分钟就算好了。（39个原子，MP2/6-31G*，453个基函数） 不过，GAUSSIAN的并行效率……不敢恭维。 如果不是专业搞计算，一台12CPU的服务器应该够了。不过现在云计算这么热门，可以考虑到各超算中心购买机时可能更简单方便。 |
2楼2012-07-30 23:59:02