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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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随风奔驰1018

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 想做一些卟啉的模拟计算,请做过类似工作的大侠帮忙报一下你们电脑的配置

主要是做卟啉分子的模拟计算,构型优化,频率计算,光谱计算等。可能未来还会接合到二氧化钛和考虑溶剂效应做进一步的计算。目前卟啉分子大概200~300个原子左右,里面有不少苯环的结构和长烷氧基链。在初始构型还行的情况下,希望在linux环境下的g09软件包下能够两三天算完,最长也不能超过一周的时间,请大家提一个电脑配置方案,特别是做过类似计算工作的大侠报一下你们电脑的配置。请大家积极发帖,谢谢大家!
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liuhuisfp

管理员

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2012-07-31 09:39:04
zhou2009: 金币+5, 代LZ发 2012-07-31 14:21:41
我最近也在算卟啉,不过体系比你的小多了,只是计算卟吩与金属的配位,原子数总共也不过40个左右。
用GAMESS US进行的计算,初始构型都是从蛋白质数据库里扣出来的,用60个CPU大概十几分钟就算好了。(39个原子,MP2/6-31G*,453个基函数)

不过,GAUSSIAN的并行效率……不敢恭维。

如果不是专业搞计算,一台12CPU的服务器应该够了。不过现在云计算这么热门,可以考虑到各超算中心购买机时可能更简单方便。
2楼2012-07-30 23:59:02
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