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如何加A尾
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飘零的叶子
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[交流]
如何加A尾
我的目的片段在1400bp左右,用了重叠延伸进行PCR,PCR中用的是Primer star,已经P出了目的条带,现在要将其与T载体连接,但是总是加不上A尾。我们是PCR结束以后跑电泳然后进行胶回收又加的A尾,试过了水浴72°30min,PCR仪72°孵育30min,加A尾都不成功,哪位大侠知道是什么原因或者有没有更好的加A尾的体系
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1楼
2012-07-28 21:18:00
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robert-RBT
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★ ★ ★
飘零的叶子(金币+1): 谢谢参与
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。
2012-07-28 22:49:40
不用加A,直接用平端载体连接就可以。或者不回收,直接补加Tag DNA polymerase,72度10-30分钟就可以。
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2楼
2012-07-28 21:45:38
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飘零的叶子
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2楼
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robert-RBT
at 2012-07-28 21:45:38
不用加A,直接用平端载体连接就可以。或者不回收,直接补加Tag DNA polymerase,72度10-30分钟就可以。
我们没有平末端载体,一直都是用T载体。如果PCR结束以后直接加Taq酶的话那非特异性扩增的片段不也加上A尾了么?!
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2012-07-28 22:14:50
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robert-RBT
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飘零的叶子
at 2012-07-28 22:14:50
我们没有平末端载体,一直都是用T载体。如果PCR结束以后直接加Taq酶的话那非特异性扩增的片段不也加上A尾了么?!...
没关系啊,最后经过切胶回收,即使有非特异性片段,也是少到可以忽略不计的程度。
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4楼
2012-07-28 23:43:49
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3楼
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Originally posted by
飘零的叶子
at 2012-07-28 22:14:50
我们没有平末端载体,一直都是用T载体。如果PCR结束以后直接加Taq酶的话那非特异性扩增的片段不也加上A尾了么?!...
没关系,最后经切胶回收后,即使有非特异性片段,也是少到可以忽略不计的程度。
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5楼
2012-07-28 23:45:41
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joan198108
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★
飘零的叶子(金币+1): 谢谢参与
我之前是不回收直接加Taq 72℃PCR仪15min,几次都成功。我一个同学是回收后不加引物,PCR 72℃10min,好像也是屡试不爽。
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6楼
2012-07-29 09:28:47
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飘零的叶子
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6楼
:
Originally posted by
joan198108
at 2012-07-29 09:28:47
我之前是不回收直接加Taq 72℃PCR仪15min,几次都成功。我一个同学是回收后不加引物,PCR 72℃10min,好像也是屡试不爽。
那具体的体系是什么呢?Taq酶,dNTP,Taq buffer要加多少呢?
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7楼
2012-07-29 09:32:50
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★
飘零的叶子(金币+1): 谢谢参与
你需要对过程进行分析,比如加入酶的量以及所需的离子浓度等等。还有就是你胶回收后得到的DNA片段是否是完整的,量是不是很多,乙醇残留量等等。总之,优化加尾之前的反应条件后,如果再不出来再考虑你的加A体系。还有,你的T载体,以及感受态之类的是否完好足以保证反应需求,也是你检验是否加了A尾的关键。
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8楼
2012-07-29 11:51:59
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joan198108
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飘零的叶子
at 2012-07-29 09:32:50
那具体的体系是什么呢?Taq酶,dNTP,Taq buffer要加多少呢?...
20μ的体系:10×buffer 2μ,Taq 0.1μ,dNTP 2μ,剩下的就是模板了。我一般是这个体系。虽然产物不回收也能顺利加A,但是感觉还是回收后加A比较,毕竟不回收还残存部分未利用的引物,在Taq的作用下,可能会产生突变点。
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9楼
2012-07-29 16:33:13
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飘零的叶子
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8楼
:
Originally posted by
云破月来xxz
at 2012-07-29 11:51:59
你需要对过程进行分析,比如加入酶的量以及所需的离子浓度等等。还有就是你胶回收后得到的DNA片段是否是完整的,量是不是很多,乙醇残留量等等。总之,优化加尾之前的反应条件后,如果再不出来再考虑你的加A体系。还 ...
回收的DNA的量不是很多,因为电泳的条带不是特别的亮,片段是不是完整这要怎么看,得测序?不过电泳时条带位置是正确的,乙醇残留量我觉得是没问题,我们一般都会开盖晾半小时的
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10楼
2012-07-30 09:09:25
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飘零的叶子
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joan198108
at 2012-07-29 16:33:13
20μ的体系:10×buffer 2μ,Taq 0.1μ,dNTP 2μ,剩下的就是模板了。我一般是这个体系。虽然产物不回收也能顺利加A,但是感觉还是回收后加A比较,毕竟不回收还残存部分未利用的引物,在Taq的作用下,可能会产生 ...
这样啊,模版量这么多,酶会不会太少点啊?!
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11楼
2012-07-30 09:44:19
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