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412667449新虫 (正式写手)
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[求助]
LPL基因序列里面有很多终止密码子，怎么回事？
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| 最近克隆了一种鱼类的LPL基因，并对其的序列进行了测定，其长度约为1500bp。但是利用Blast里面的Translate程序进行翻译时，里面有将近15个终止密码子。至怎么回事啊？不是开放阅读框不能被终止密码子打断吗？为什么别人做出来的鱼LPL基因怎么翻译出来都是很连续的？跪求高人指点。 |
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【答案】应助回帖
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412667449: 金币+20, ★★★很有帮助, 回答的很专业啊，谢谢，我是这方面的额菜鸟，根据您的建议我再进一步看一看，万分感谢啊 2012-07-31 09:10:41
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| 有2种可能。可能有内含子。你可以通过race得到cDNA后，剔除内含子后分析。也可以利用软件分析预测内含子，如http://augustus.gobics.de/。也有可能测序或克隆出现移码或错配的情况。这种情况可以通过高保真酶扩增序列来避免。如Phusion high-fidelity DNA polymerase. |
2楼2012-07-30 21:47:04
jiangpeace
铁虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
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- 虫号: 1434781
- 注册: 2011-10-10
- 性别: MM
- 专业: 代数学
3楼2012-08-18 15:04:52