[求助] DNA测序后为什么拼接

1楼2012-07-25 23:24:13

ZOEY21

金虫 (小有名气)

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序列如果是双向测序的话需要进行正反向拼接可以用CExpress
因为测序结果首尾的几十个碱基是不准确的拼接找到两条序列重合的部分不确定的碱基根据峰图清晰的那个确定好吧我是这么做的
不只是16SrDNA

2楼2012-07-26 08:55:27

sd3824289

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

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拼接就是在测序完成以后，序列是分段的，要将这些分段的序列重新组合成原来的序列！这个过程需要借助相应的软件来完成！而且有时候拼接是必不可少的环节！

坚持，就像流星，即使知道最后的结果，也要勇敢的走到最后！

3楼2012-07-26 09:17:36

wu_shiyong

银虫 (正式写手)

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一代测序一般只能测500bp左右，而且钱100和后100一般可信度不高的你看看测序的峰图就明白了，二代要多，现在大多数都是一代。16S片段太长都是用primer walking，一段一段的测，最后拼接在一起成完整的序列！

低调稳重务实内敛---------------残

4楼2012-07-26 09:24:13

gwbk

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直接告诉测序公司要求他们拼接就可以啦，至于为什么拼接，16srDNA约有1600bp，测序一个序列准确长度600-800bp，双向测2个或3个序列，所以需要把2个或3个片段拼接起来形成完整片段

5楼2012-07-26 11:02:22

gungunak47

铁虫 (初入文坛)

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拼接顾名思义就是把测序后的几条序列拼接到一起成为一条

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6楼2012-07-26 14:47:40

84146922

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现在的测序好像只能做到一个反应测700bp,超过了就要一段一段测序，然后拼接在一起，而且，测序前后的十多个碱基一般很难准。

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7楼2012-07-26 23:16:08

damaomao

禁虫 (正式写手)

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8楼2012-07-28 10:00:44

tianchunying

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【答案】应助回帖

测序都是分段的，每段大约800个碱基，而且前后段都是不太准确的，拼接到一起才是你要看的整个测序片段

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天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物。

9楼2013-03-01 10:05:02