24小时热门版块排行榜    

查看: 5172  |  回复: 8

草山残梦

新虫 (小有名气)

[求助] DNA测序后为什么拼接

16S rDNA经测序后为什么要拼接,这里的“拼接”是什么意思啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZOEY21

金虫 (小有名气)

序列如果是双向测序的话 需要进行正反向拼接 可以用CExpress
因为测序结果首尾的几十个碱基是不准确的 拼接找到两条序列重合的部分 不确定的碱基根据峰图清晰的那个确定 好吧 我是这么做的
不只是16SrDNA
2楼2012-07-26 08:55:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sd3824289

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 正解 2012-07-26 15:29:56
拼接就是在测序完成以后,序列是分段的,要将这些分段的序列重新组合成原来的序列!这个过程需要借助相应的软件来完成!而且有时候拼接是必不可少的环节!
坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
3楼2012-07-26 09:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wu_shiyong

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-26 15:30:16
一代测序一般只能测500bp左右,而且钱100和后100一般可信度不高的你看看测序的峰图就明白了,二代要多,现在大多数都是一代。16S片段太长都是用primer walking,一段一段的测,最后拼接在一起成完整的序列!
低调稳重务实内敛---------------残
4楼2012-07-26 09:24:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)

直接告诉测序公司要求他们拼接就可以啦,至于为什么拼接,16srDNA约有1600bp,测序一个序列准确长度600-800bp,双向测2个或3个序列,所以需要把2个或3个片段拼接起来形成完整片段
5楼2012-07-26 11:02:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gungunak47

铁虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
拼接  顾名思义 就是把测序后的几条序列 拼接到一起 成为一条
6楼2012-07-26 14:47:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

84146922

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
现在的测序好像只能做到一个反应测700bp,超过了就要一段一段测序,然后拼接在一起,而且,测序前后的十多个碱基一般很难准。
7楼2012-07-26 23:16:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaomao

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

8楼2012-07-28 10:00:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianchunying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

测序都是分段的,每段大约800个碱基,而且前后段都是不太准确的,拼接到一起才是你要看的整个测序片段
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
9楼2013-03-01 10:05:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 草山残梦 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 09:01 by 每天只摆一小会
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-03-18 5/250 2026-03-20 09:00 by ZHANG0tao
[考研] 281求调剂(0805) +11 烟汐忆海 2026-03-16 21/1050 2026-03-20 08:45 by 无际的草原
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +9 Ymlll 2026-03-18 12/600 2026-03-20 00:01 by 23Postgrad
[考研] 288求调剂 +15 于海海海海 2026-03-19 15/750 2026-03-19 22:41 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +3 葵梓卫队 2026-03-18 5/250 2026-03-19 19:35 by 给你你注意休息
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +8 zlingli 2026-03-13 8/400 2026-03-19 16:32 by 轻松不少随
[考研] 求调剂 +3 Mqqqqqq 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:11 by peike
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-19 3/150 2026-03-19 13:36 by houyaoxu
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +4 守候夕阳CF 2026-03-18 4/200 2026-03-18 22:16 by li123456789.
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
信息提示
请填处理意见