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zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 急问,怎么得到蛋白复合物中的蛋白和配体的结合界面

请问,能否使用VMD将一蛋白复合物的结合界面选取出来,得到它们的结合位点?还是可以使用其他什么工具可以得到呀?
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zmz148002989

新虫 (初入文坛)


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-08-01 20:23:34
VMD 也很简单啊,提取出来报存成PDB文件就可以了啊。 within 语句和writepdb 两个语句就可以轻松搞定
8楼2012-08-01 12:17:06
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查看全部 9 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-24 17:30:57
you can use Pymol.
2楼2012-07-24 17:13:43
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zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-24 17:13:43
you can use Pymol.

Can you give me some tutorial?
4楼2012-07-24 18:21:06
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-24 21:18:53
zhongshun: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2012-07-26 15:17:15
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhongshun at 2012-07-24 18:21:06
Can you give me some tutorial?...

俺当时在linux下,不方便打中文~哈哈~pymol很简单的~~~教程可以看这里http://wenku.baidu.com/view/483b70fa0242a8956bece41f.html
5楼2012-07-24 20:19:08
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