应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 急问，怎么得到蛋白复合物中的蛋白和配体的结合界面
91/1返回列表
查看: 1514  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 急问，怎么得到蛋白复合物中的蛋白和配体的结合界面

请问，能否使用VMD将一蛋白复合物的结合界面选取出来，得到它们的结合位点？还是可以使用其他什么工具可以得到呀？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-07-24 16:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-24 17:30:57
you can use Pymol.
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-24 17:13:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名
本帖仅楼主可见
3楼2012-07-24 17:36:49
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-24 17:13:43
you can use Pymol.

Can you give me some tutorial?
赞一下 回复此楼
4楼2012-07-24 18:21:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-24 21:18:53
zhongshun: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2012-07-26 15:17:15
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhongshun at 2012-07-24 18:21:06
Can you give me some tutorial?...

俺当时在linux下，不方便打中文~哈哈~pymol很简单的~~~教程可以看这里http://wenku.baidu.com/view/483b70fa0242a8956bece41f.html
赞一下 回复此楼
5楼2012-07-24 20:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-24 20:19:08
俺当时在linux下，不方便打中文~哈哈~pymol很简单的~~~教程可以看这里http://wenku.baidu.com/view/483b70fa0242a8956bece41f.html...

呵呵，我看看先哈
回复此楼
6楼2012-07-24 20:45:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)
我还是没找到相关的那部分内容呀，能具体指明在哪或是大概说一下步骤吗？  感觉Pymol比vmd难呀
赞一下 回复此楼
7楼2012-07-24 21:42:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmz148002989

新虫 (初入文坛)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-08-01 20:23:34
VMD 也很简单啊，提取出来报存成PDB文件就可以了啊。 within 语句和writepdb 两个语句就可以轻松搞定
赞一下 回复此楼
8楼2012-08-01 12:17:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zmz148002989 at 2012-08-01 12:17:06
VMD 也很简单啊，提取出来报存成PDB文件就可以了啊。 within 语句和writepdb 两个语句就可以轻松搞定

within 语句怎么用在选取两个蛋白的结合界面上呀
赞一下 回复此楼
9楼2012-08-12 19:50:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhongshun 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程274求调剂 +4 Lilithan 2026-03-01 4/200 2026-03-02 12:06 by yuchj
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 9/450 2026-03-02 12:04 by 52hz~~
[考研] 哈工大计算机刘劼团队招生 +4 hit_aiot 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:53 by 一声问好
[考研] 276求调剂 +4 路lyh123 2026-02-28 5/250 2026-03-02 11:20 by yuchj
[考研] 284求调剂 +10 天下熯 2026-02-28 11/550 2026-03-02 11:03 by 无际的草原
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分，求调剂 +6 wsl111 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:00 by ydudjddnd
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by lature00
[考研] 282求调剂 +3 2103240126 2026-03-02 4/200 2026-03-02 09:25 by 汪！？！
[考研] 材料复试调剂 +4 学材料的点 2026-03-01 5/250 2026-03-02 08:26 by houyaoxu
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博！
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 290求调剂 +9 材料专硕调剂； 2026-02-28 11/550 2026-03-01 17:21 by sunny81
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业，申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭