24小时热门版块排行榜    

查看: 820  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

77638333

金虫 (著名写手)

[求助] 这样的BLAST结果如何取舍?

有时出现2个基因名称,分别点击,均有序列,而且不同。那么是按照基因名称与进行比对的基因名称是否一致,还是按照配对的碱基位置进行取舍,或是皆附上?

BLAST的目的是为下一步设计通用引物做准备。
回复此楼
喝啥别喝三鹿,学啥别学生物
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sd3824289

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以参考一下功能注释!
坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
10楼2012-07-24 10:42:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

tiani_tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得应该按照E值来判断,E值越低,说明相似度越高,也就是你想要的序列了。检索一段序列,应该不会出现两个名称啊,除非是别称
4楼2012-07-23 12:16:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

77638333

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tiani_tan at 2012-07-23 12:16:35
我觉得应该按照E值来判断,E值越低,说明相似度越高,也就是你想要的序列了。检索一段序列,应该不会出现两个名称啊,除非是别称

已经出现了,怎么办?而且分别对映两个序列。见截图。
喝啥别喝三鹿,学啥别学生物
5楼2012-07-23 15:07:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这很正常,不同的时间大家提交的序列是完全一样的,有这个可能,本来NCBI就是一个开放的平台,看看这两个序列,应该不是出自同一片参考文献,找那篇最近的就OK了
6楼2012-07-23 20:00:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见