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cls1215

铜虫 (正式写手)

[交流] 蛋白质分析常用软件

蛋白质分析常用软件

AnthePro 5.0 1.9兆,蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 5.0,包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容,功能非常强大。应用此软件包,使用个人电脑,便能进行各种蛋白序列分析与特性预测,包括:进行蛋白序列二级结构预测;在蛋白序列中查找符合PROSITES数据库的特征序列;绘制出蛋白序列的所有理化特性曲线;在Internet或本地蛋白序列数据库中查找类似序列;计算蛋白序列分子量,比重与各蛋白残基百分组成;计算蛋白序列滴定曲线与等电点;选定一个片段后,绘制Helical Wheel图;进行点阵图(Dot Plot)分析;计算信号肽潜在的断裂位点等功能。 ,ddoII  
qe M`z  
  分析蛋白序列所需要的Prosite蛋白数据库 1.4兆 与Swiss-Prot蛋白数据库41版,85.7兆左右,压缩格式。下载后,将其放置在ANTHEPROT 5.0同一个目录,便可在本地使用程序的检索功能。 Nj p?/r  
  中文使用介绍 122K,希望对大家的使用有所帮助。 原始网站。 %I`%N2ss  
G\PFh&  
?TLzOYJp  
PSAAM 390 K, 蛋白质序列分析软件包。 原始网址。 j96\({;k  
VHMPT 760K,VHMPT(Viewer and editor for Helical Membrane Protein Topologies)是螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件,可以自动生成带有跨膜螺旋的蛋白的示意性2维拓扑结构,并可对拓扑结构进行交互编辑。由台湾生物医学科学研究所的黄明经博士编制。安装Tcl 8.0 (7M)方可运行。原始网站。 `;v5o4.`  
WinPep3.01 1.5M,分析蛋白序列的工具软件。拥有一些常用的蛋白序列分析功能。原始网站。 NB#-W4NA  
MPEx 2.2a 2.2M,(Membrane Protein Explorer)研究膜蛋白拓扑学结构和其它特性的JAVA软件。软件可以很方便地使用膜蛋白拓扑结构数据库MPtopo,(a database of Membrane Protein topology)。需要JAVA运行环境。原始网站。 Izr_]%  
Osprey 1.2.0 21.9M,蛋白质相互作用网络可视化系统。是加拿大多伦多大学一个生物信息学研究组开发的,目的在于更好的研究蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks)和蛋白质复合物。软件本身和(BIND,GRID)数据库整合,涉及到蛋白质、核酸序列又和GenBank交叉链接。使用手册,4.7M,PDF格式。原始网站。 /+g)J0u  
PIN 2.0 7.6M,(protein-protein Interaction Networks)的简称,显示蛋白质交互作用网络和功能注释软件。软件中包括酵母蛋白交互作用数据。软件作者是中科院计算所。原始网站。 Uh=@8v  
InterViewer 4.0 760K。显示和分析蛋白交互作用软件,据其网站介绍,运行速度比其他软件快许多。原始网站。 3Lw&HtH  
Fiter 1.0 180K,本免费中文软件可以对蛋白质的MALDI-TOF分析结果数据(其它数据作者未做测试)进行角蛋白、牛胰蛋白和猪胰蛋白自切峰的滤除,也可对自定义任意数据进行滤除。角蛋白、牛胰蛋白和猪胰蛋白自切峰由NCBA提供。由作者杨亮和霍晨敏授权生物软件网发布。软件运行需要先安装微软的.net framework,23M。简单使用说明,200K。 wM aqR"%  
GPMAW 6.0 DEMO 3.2M,General Protein/Mass Analysis for Windows的缩写,蛋白质质谱与序列分析软件。可全功能免费用30次,主要用于蛋白与多肽的质谱分析,也具有其他蛋白序列分析功能,如比对、二级结构分析等等。注册费用280美元。原始网站。 U?.cbB ,  
STORM 1.01 24M 可以同时对蛋白序列进行BLAST/FASTA/Pfam/ProtParam分析软件,并将结果输出

[ Last edited by sunbuct on 2008-9-24 at 14:59 ]
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nancy223

金虫 (正式写手)

很多地方乱码啊
2楼2008-04-14 14:05:28
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