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zhang_jaj

木虫 (正式写手)

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[求助] 坐标文件判断是fcc，hcp，bcc，sc等结构的算法或者方法

用towhee模拟ar气低温在界面上的成核行为。出来的结果文件是pdb格式的坐标文件。现在想知道这些原子中哪些部分是固体，哪些部分是液体。还有事固体的怎么来判断结构是fcc还是hcp或者bcc之类的，有什么编程的算法，或者是已有的软件可以判断吗？总感觉用可视化软件直接看的话不是很靠谱啊

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1楼2012-07-17 11:57:25

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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

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★ ★
zh1987hs: 金币+2, lei版回来喽！哈哈 2012-07-20 21:02:24

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1796494
8楼

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6楼2012-07-18 13:25:46

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lr553104284

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-07-17 21:10:37
zhang_jaj: 金币+20, ★★★很有帮助, 非常感谢，我先自己了解下再请教你 2012-07-18 11:58:16

大致有三种比较流行的方法如下：Pair Analysis, Voronoi Polyhedron, Bond Orientational Order Parameter!可以网上查一查，希望对你有所帮助。

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2楼2012-07-17 21:05:39

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lzl8181

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by lr553104284 at 2012-07-17 21:05:39
大致有三种比较流行的方法如下：Pair Analysis, Voronoi Polyhedron, Bond Orientational Order Parameter!可以网上查一查，希望对你有所帮助。

老兄，小弟编程能力太低，请问有没有相关软件来做这几种分析？特别是Pair Analysis。

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