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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 小球藻(Chlorella)基因组有没有公布？
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hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 小球藻(Chlorella)基因组有没有公布？

请问各位有没有做小球藻的。小球藻(Chlorella)的基因组有没有公布？为什么我在NCBI和EBI上都找不到小球藻的基因组序列？我只找到很多cDNA、rRNA和各种酶的基因序列信息，求助！~
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1楼 2012-07-15 21:04:37
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 09:16:41
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2224352
是这篇文章http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9159184
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2楼2012-07-15 23:04:23
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 10:48:49
还有个Chlorella vulgaris的基因组
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700
但是这个是比较粗略的测序
不如上面那个编号694的

从描述上看 Chlorella variabilis是多种双链DNA病毒的宿主 是研究藻类-病毒相互作用的重要模板
在Genome里面还可以找到至少5种与Chlorella的病毒序列
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7楼2012-07-16 10:16:19
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)
hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 16:14:22
上面那个贴错了。。。。
应该是这个
http://genome.jgi-psf.org/Chlvu1/Chlvu1.download.ftp.html
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10楼2012-07-16 12:36:30
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普通回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)
这个是好东西。据说可以做下一代的生物质能源的材料。
加油加油！
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3楼2012-07-16 00:04:57
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jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
咱没做过，但是你可以去NCBI，选genome，然后输入小球藻的学名，如果有全基因组的话，肯定会跳出来的
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4楼2012-07-16 08:53:20
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hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-07-15 23:04:23
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2224352
是这篇文章http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9159184

这是小球藻叶绿体的基因组序列，不知道有没有核基因组的序列
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5楼2012-07-16 09:11:59
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hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-16 08:53:20
咱没做过，但是你可以去NCBI，选genome，然后输入小球藻的学名，如果有全基因组的话，肯定会跳出来的

我试过了，跳出来这个页面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/694
你能帮我看看吗？
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6楼2012-07-16 09:26:41
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hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Davidzjy at 2012-07-16 10:16:19
还有个Chlorella vulgaris的基因组
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700
但是这个是比较粗略的测序
不如上面那个编号694的

从描述上看 Chlorella variabilis是多种双链DNA病毒的宿主 是研究藻类-病毒相互 ...

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700上显示 No data [1]，我要怎么样才能得到基因组序列的文件？
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8楼2012-07-16 10:48:38
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
hugh_hang: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-16 16:14:37
引用回帖:
8楼: Originally posted by hugh_hang at 2012-07-16 10:48:38
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700上显示 No data ，我要怎么样才能得到基因组序列的文件？...

如果你一定要看到完整序列的话 下载在这里
http://genome.jgi-sf.org/Coc_C169_1/Coc_C169_1.download.ftp.html
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9楼2012-07-16 12:34:06
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