24小时热门版块排行榜    

查看: 1775  |  回复: 12

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 小球藻(Chlorella)基因组有没有公布?

请问各位有没有做小球藻的。小球藻(Chlorella)的基因组有没有公布?为什么我在NCBI和EBI上都找不到小球藻的基因组序列?我只找到很多cDNA、rRNA和各种酶的基因序列信息,求助!~
回复此楼
miracles happen everyday, some people don't think so but they do!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有3个 )

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 09:16:41
2楼2012-07-15 23:04:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 10:48:49
还有个Chlorella vulgaris的基因组
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700
但是这个是比较粗略的测序
不如上面那个编号694的

从描述上看 Chlorella variabilis是多种双链DNA病毒的宿主 是研究藻类-病毒相互作用的重要模板
在Genome里面还可以找到至少5种与Chlorella的病毒序列
7楼2012-07-16 10:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

hugh_hang: 回帖置顶 2012-07-16 16:14:22
上面那个贴错了。。。。
应该是这个
http://genome.jgi-psf.org/Chlvu1/Chlvu1.download.ftp.html
10楼2012-07-16 12:36:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

这个是好东西。据说可以做下一代的生物质能源的材料。
加油加油!
3楼2012-07-16 00:04:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
咱没做过,但是你可以去NCBI,选genome,然后输入小球藻的学名,如果有全基因组的话,肯定会跳出来的
4楼2012-07-16 08:53:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-07-15 23:04:23
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2224352
是这篇文章http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9159184

这是小球藻叶绿体的基因组序列,不知道有没有核基因组的序列
miracles happen everyday, some people don't think so but they do!
5楼2012-07-16 09:11:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-16 08:53:20
咱没做过,但是你可以去NCBI,选genome,然后输入小球藻的学名,如果有全基因组的话,肯定会跳出来的

我试过了,跳出来这个页面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/694
你能帮我看看吗?
miracles happen everyday, some people don't think so but they do!
6楼2012-07-16 09:26:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by Davidzjy at 2012-07-16 10:16:19
还有个Chlorella vulgaris的基因组
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700
但是这个是比较粗略的测序
不如上面那个编号694的

从描述上看 Chlorella variabilis是多种双链DNA病毒的宿主 是研究藻类-病毒相互 ...

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700上显示 No data [1],我要怎么样才能得到基因组序列的文件?
miracles happen everyday, some people don't think so but they do!
8楼2012-07-16 10:48:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
hugh_hang: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-16 16:14:37
引用回帖:
8楼: Originally posted by hugh_hang at 2012-07-16 10:48:38
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/700上显示 No data ,我要怎么样才能得到基因组序列的文件?...

如果你一定要看到完整序列的话 下载在这里
http://genome.jgi-sf.org/Coc_C169_1/Coc_C169_1.download.ftp.html
9楼2012-07-16 12:34:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hugh_hang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] filecode +8 documentary 2026-08-10 8/400 2026-08-10 19:20 by loufangrui
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +10 yufeiwaner 2026-08-09 11/550 2026-08-10 18:47 by yufeiwaner
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +14 Lanmanbaby 2026-08-09 22/1100 2026-08-10 14:57 by wwncly
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +4 布布和一二 2026-08-10 4/200 2026-08-10 14:50 by 医学老男孩
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +11 archvillain 2026-08-04 13/650 2026-08-10 14:41 by seekfind
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
信息提示
请填处理意见