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tuer

新虫 (小有名气)

[求助] 求助晶体解析中的B类错误

本人是新手刚开始接触结晶体,check之后经修改剩下以下三个B类错误,求高人指点!!
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 9.0 Ratio
PLAT222_ALERT_3_B Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 9.6 Ratio
PLAT242_ALERT_2_B Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C15
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+2, 感谢参与交流,解答的很详细,希望对楼主有帮助 2012-07-14 08:30:00
tuer: 金币+20, 有帮助 2012-07-15 20:52:41
第一个的解决方法

SIMU 0.01 0.02 3.8 $C

第二个问题
建议把氢删除用理论加氢, 或者把热参数改成-1.20000

第三个问题
C15可能要做劈裂处理。
学无止境
2楼2012-07-13 23:42:33
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tuer

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-13 23:42:33
第一个的解决方法

SIMU 0.01 0.02 3.8 $C

第二个问题
建议把氢删除用理论加氢, 或者把热参数改成-1.20000

第三个问题
C15可能要做劈裂处理。

谢谢哈,由于是菜鸟您的第三个办法“C15可能要做劈裂处理”具体怎么操作不会呀,但是用了您的前两个办法后最后一个B类错误不知道为什么也没了,就剩这一个了:PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 6.6 Ratio请问要怎么解决啊?
3楼2012-07-15 21:17:01
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

理论上用了第一个命令之后就能解决这个问题了。 估计你有碳原子无序了。你去LST文件里面看一下有无碳原子劈裂的现象。
找到 Principal mean square atomic displacements U
下面就是原子列表。 有劈裂的就会在该原子后面写着:
may be split into  0.6258  0.2177  0.3140  and  0.6169  0.1924  0.3010
学无止境
4楼2012-07-16 01:18:31
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tuer

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 01:18:31
理论上用了第一个命令之后就能解决这个问题了。 估计你有碳原子无序了。你去LST文件里面看一下有无碳原子劈裂的现象。
找到 Principal mean square atomic displacements U
下面就是原子列表。 有劈裂的就会在该原 ...

刚看看了没有劈裂啊,碳原子无序要怎么处理啊?
5楼2012-07-16 10:07:41
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tuer at 2012-07-15 14:07:41
刚看看了没有劈裂啊,碳原子无序要怎么处理啊?...

无序的处理其实不难,但是靠这样也说不清楚。

FVAR  0.133620  0.782250

PART 1
Ru3    5   0.580850  0.408430  0.805911 21.000000  0.03
PART 2
Ru4    5   0.506974  0.375615  0.647275 -21.000000  0.03
PART 0

要用到上面的part命令。
学无止境
6楼2012-07-16 21:36:12
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tuer at 2012-07-15 14:07:41
刚看看了没有劈裂啊,碳原子无序要怎么处理啊?...

你是用的xp么?最好找出是那个C用问题。
学无止境
7楼2012-07-16 21:36:48
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tuer

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 21:36:48
你是用的xp么?最好找出是那个C用问题。...

哦,我是用shelxt解的,从热振动看应该是C16有问题
8楼2012-07-16 21:43:19
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tuer

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 21:36:12
无序的处理其实不难,但是靠这样也说不清楚。

FVAR  0.133620  0.782250

PART 1
Ru3    5   0.580850  0.408430  0.805911 21.000000  0.03
PART 2
Ru4    5   0.506974  0.375615  0.647275 -21.000000  ...

额。。。这个具体的怎么用啊,直接复制到ins文件里就行吗?太麻烦你拉!!
9楼2012-07-16 21:44:41
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

我建议你先把C16 ISOR一下看看会不会解决问题。
学无止境
10楼2012-07-16 22:07:42
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