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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 有关构建遗传连锁图谱的疑问~
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)

[求助] 有关构建遗传连锁图谱的疑问~ 已有1人参与

想问一下，遗传连锁图谱是只针对杂交亲本与子代之间建立的么？？？SSR的遗传图谱对于引物有要求吗？还是筛选出有多态性的就行了？还有一般最少是多少对引物，多少个样进行建立呢？跑出条带之后就一定能构建么？
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1楼 2012-07-11 10:10:57
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似水骄阳sun

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-11 21:36:19
silicare: 金币+8, BioEPI+1, 应助指数+1, 鼓励新虫发帖交流 2012-07-12 09:23:38
是这样的，你所筛选的引物多少是要要以你所做的物种而定的，你的物种的染色体数如果比较多，多筛些引物结果会有价值写，最好你晒出引物所建立的连锁群数是可以和你的染色体数一致的。至于引物，你可以搜集已发表的近缘的引物序列来试试，这样或许可以减少很多无用功，SSR是没有什么通用引物的。
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4楼2012-07-11 21:29:43
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
本人也不算了解，据看过边上的人做，一般SSR要筛选出有多态性的，引物100多，个体100多，但现在都流行更多200-300,小做参考吧！
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2楼2012-07-11 12:27:29
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-11 12:27:29
本人也不算了解，据看过边上的人做，一般SSR要筛选出有多态性的，引物100多，个体100多，但现在都流行更多200-300,小做参考吧！

OMG！只是一个小小的硕士毕业论文也要那么多么？身边在做的人能帮我看看这个问题回答一下不？感激不尽啊~~！！
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3楼2012-07-11 16:22:24
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
个体100左右是肯定要的，引物尽量接近100吧，不然做出来不准也难看。
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5楼2012-07-12 15:38:07
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yuanbeauty

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
植物遗传图谱构建的群体有F2，BC和RIL等。构建图谱的SSR引物数是越多越好，与物种有关（同意二楼），其中会出现一些标记无法作到图上。PCR-跑胶-统计—软件分析。至于个体数，可以用94个个体（F2群体）。以上共参考。
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6楼2012-07-12 16:14:32
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bluesun5198

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这是个痛苦的过程啊，做标记的人伤不起。 看你物种的染色体组数多少定的，SSR作图效率不高，除非有非常多的SSR引物
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7楼2012-11-09 16:11:55
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北极星※

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 鹫羽0711 at 2012-07-11 16:22:24
OMG！只是一个小小的硕士毕业论文也要那么多么？身边在做的人能帮我看看这个问题回答一下不？感激不尽啊~~！！...

如果是植物的话是不是要用重组自交系来做？
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8楼2013-05-18 21:58:23
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_紫罗兰_

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by yuanbeauty at 2012-07-12 16:14:32
植物遗传图谱构建的群体有F2，BC和RIL等。构建图谱的SSR引物数是越多越好，与物种有关（同意二楼），其中会出现一些标记无法作到图上。PCR-跑胶-统计—软件分析。至于个体数，可以用94个个体（F2群体）。以上共参考 ...

您好，我现在也是用F2群体，大小只有90左右，问题严重吗，好紧张啊现在。谢谢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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9楼2014-11-22 17:20:59
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hgweiweicz

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by _紫罗兰_ at 2014-11-22 17:20:59
您好，我现在也是用F2群体，大小只有90左右，问题严重吗，好紧张啊现在。谢谢
...

想问问你的实验结果出来了么？！图谱构得怎么样？！
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10楼2015-01-19 15:52:48
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