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wangcongxs银虫 (著名写手)
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PCR不出带,求教
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| 我用酶切连接后的产物进行预扩增,退火温度度降到48度才有目的带(引物TM值一条55.75,一条52.18),然后把预扩增产物稀释10倍进行选扩增,跑6%的变性PAGE,PCR25ul的体系,buffer2.5ul,镁离子1.5,DNTP1.0,引物(10uM)1.5,rTaq0.3,PCR程序用touchdown,从65降至56。我用的是我们老师做的体系,只是模板不一样,可是物种是一样的,为什么一直扩不出带啊,难道预扩就是假阳性?但是退火温度高了只有弥散啊,请各位朋友帮忙提提意见……不胜感激! |
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wangcongxs
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12楼2012-07-19 09:11:12
shenye.judy
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【答案】应助回帖
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wangcongxs: 金币+5 2012-07-17 08:07:35
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wangcongxs: 金币+5 2012-07-17 08:07:35
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预扩增用了48度才有的,之后是65降至56,在48度之上,没有产物似乎也有道理。 PCR体系中镁离子浓度也是关键,你可以查查,然后调整或者做梯度。 如果你们老师同样体系做出来,你没做出来,那就是模板有问题的可能性还是比较大的. 当然,你也要确定你的预扩增条带是正确的。 预扩增弥散的产物也可以试试往下做,可能是你的引物不够特异,扩出了其它,但应该包含你的目标吧? 也不知道你是在做什么,所以只能这样回答些。 |
2楼2012-07-10 10:50:45
wangcongxs
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