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zq553800559

金虫 (正式写手)


[交流] 算IC50的进来一下

本人有两个问题:望高人指点一下:


1. 本人有个药物的IC5原始数据,别人帮测的,
五个药物的浓度,100,80,60,40,20,相应的抑制率,
我那个同学说这个IC50也用
改良寇式法:   lgIC50=Xm-I(P-(3-Pm-Pn)/4)
                     Xm:lg 最大剂量
              I:lg(最大剂量/相临剂量)
                   P:阳性反应率之和
               Pm:最大阳性反应率
               Pn:最小阳性反应率
计算 我觉得既然是等差数列,那么计算直接把线画出来就在先上求抑制率为0.5的那个相应的药物浓度既不是我要的IC50吗?我这样想对不对?


2.我同学设计药物溶度的时候,由于高浓度的药物的抑制率很高,在平台区,所以降低浓度帮我重做,可是设计的浓度让我不解: 20 ;10 ;1 ;0.1 ;0.01
这既不是等比数列又不是等差的怎么算IC50啊?用改良宼式法吗?
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zqx1990

木虫 (正式写手)


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zq553800559: 金币+1, 切,五个金币又不是五块人民币,哈哈 不要紧 这个公式我只是不知道怎么推到出来,我觉得可能那个公式是基于等比数列的浓度的基础上设计的算法 2012-07-10 16:12:03
zq553800559: 金币+1, 毕竟有log成线性的话就应该是等比数列,logA0-xlog(q),x为斜率。。。? 2012-07-10 16:13:14
引用回帖:
5楼: Originally posted by zqx1990 at 2012-07-09 21:34:52
我这里有一个我自己用VB做的IC50值计算器,输入浓度和抑制率就可以算出来。

可惜我好早的事了,我找了一下电脑里的东西,不见了,是因为后来我不做这个了,代码源和程序文件都已经删除啦,我大概记得就是通过改良寇式法公式做的,真的很简单,哈哈,学过VB的都能做出来,呵呵,不是什么高端货,我自己都感觉对不起你的5个金币啊,谢谢!祝你成功!
8楼2012-07-10 11:40:57
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橘julia

金虫 (小有名气)


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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:45:49
zq553800559: 金币+5 2012-07-12 07:17:09
可以采用spss软件计算IC50值,里面会有线性回归,我们实验室一般会用这个软件来计算的。
2楼2012-07-09 19:21:36
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xfdy

金虫 (正式写手)


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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:45:55
zq553800559: 金币+5, 浓度设计他说只要有梯度就行了 我觉得应该是等比数列才行你说呢? 2012-07-10 09:04:12
zq553800559: 金币+1, 你觉得这种浓度设计可以用sigmaplot计算,或者是改良寇式法? 2012-07-10 16:14:37
我们用的是sigmaplot计算 不过你的那个浓度梯度 不明白 你问你朋友呀
3楼2012-07-09 20:53:07
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smilingsly

木虫 (小有名气)


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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:46:04
zq553800559: 金币+5 2012-07-12 07:16:57
用original或者prism里头的dose-response模型可以直接得出ic50,抑制率-浓度曲线不是直线而是S型线,所以最好用软件别自己算。
4楼2012-07-09 20:56:49
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