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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物化学 » 算IC50的进来一下
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zq553800559

金虫 (正式写手)

[交流] 算IC50的进来一下

本人有两个问题：望高人指点一下：


1. 本人有个药物的IC5原始数据，别人帮测的，
五个药物的浓度，100，80，60，40，20，相应的抑制率，
我那个同学说这个IC50也用
改良寇式法:   lgIC50=Xm-I(P-(3-Pm-Pn)/4)
                     Xm:lg 最大剂量
              I:lg(最大剂量/相临剂量)
              　    P:阳性反应率之和
              　Pm:最大阳性反应率
              　Pn:最小阳性反应率
计算 我觉得既然是等差数列，那么计算直接把线画出来就在先上求抑制率为0.5的那个相应的药物浓度既不是我要的IC50吗？我这样想对不对？


2.我同学设计药物溶度的时候，由于高浓度的药物的抑制率很高，在平台区，所以降低浓度帮我重做，可是设计的浓度让我不解: 20 ;10 ;1 ;0.1 ;0.01
这既不是等比数列又不是等差的怎么算IC50啊？用改良宼式法吗？
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1楼 2012-07-09 16:05:36
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橘julia

金虫 (小有名气)
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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:45:49
zq553800559: 金币+5 2012-07-12 07:17:09
可以采用spss软件计算IC50值，里面会有线性回归，我们实验室一般会用这个软件来计算的。
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2楼2012-07-09 19:21:36
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xfdy

金虫 (正式写手)
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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:45:55
zq553800559: 金币+5, 浓度设计他说只要有梯度就行了 我觉得应该是等比数列才行你说呢？ 2012-07-10 09:04:12
zq553800559: 金币+1, 你觉得这种浓度设计可以用sigmaplot计算，或者是改良寇式法? 2012-07-10 16:14:37
我们用的是sigmaplot计算 不过你的那个浓度梯度 不明白 你问你朋友呀
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3楼2012-07-09 20:53:07
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smilingsly

木虫 (小有名气)
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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:46:04
zq553800559: 金币+5 2012-07-12 07:16:57
用original或者prism里头的dose-response模型可以直接得出ic50，抑制率-浓度曲线不是直线而是S型线，所以最好用软件别自己算。
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4楼2012-07-09 20:56:49
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zqx1990

木虫 (正式写手)
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xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-07-09 21:46:11
zq553800559: 金币+5, 谢谢 ，把你代码发一下吧 我看看 2012-07-10 09:03:35
我这里有一个我自己用VB做的IC50值计算器，输入浓度和抑制率就可以算出来。
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5楼2012-07-09 21:34:52
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zqx1990

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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zq553800559: 金币+1, 切，五个金币又不是五块人民币，哈哈 不要紧 这个公式我只是不知道怎么推到出来，我觉得可能那个公式是基于等比数列的浓度的基础上设计的算法 2012-07-10 16:12:03
zq553800559: 金币+1, 毕竟有log成线性的话就应该是等比数列，logA0-xlog(q),x为斜率。。。？ 2012-07-10 16:13:14
引用回帖:
5楼: Originally posted by zqx1990 at 2012-07-09 21:34:52
我这里有一个我自己用VB做的IC50值计算器，输入浓度和抑制率就可以算出来。

可惜我好早的事了，我找了一下电脑里的东西，不见了，是因为后来我不做这个了，代码源和程序文件都已经删除啦，我大概记得就是通过改良寇式法公式做的，真的很简单，哈哈，学过VB的都能做出来，呵呵，不是什么高端货，我自己都感觉对不起你的5个金币啊，谢谢！祝你成功！
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8楼2012-07-10 11:40:57
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493227635

新虫 (初入文坛)
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豆哥: 金币+1, 谢谢参与交流 2012-07-11 13:16:49
zq553800559: 金币+1, 药物浓度是否等比，等差都没有太大关系？ 2012-07-12 07:16:15
我这也有一个算IC50的软件，至于浓度的设置应该根据你的抑制率，最好一部分浓度抑制率大于50，另一部分浓度抑制率小于50，这样比较准确，而且尽量不要设置平台期的，也要考虑到药物的毒性
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9楼2012-07-11 13:05:21
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lzh_cindy

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
2楼: Originally posted by 橘julia at 2012-07-09 19:21:36
可以采用spss软件计算IC50值，里面会有线性回归，我们实验室一般会用这个软件来计算的。

请问虫友，经过线性回归后得到的回归方程，哪个值是IC50呀？望指点迷津。
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11楼2012-09-11 15:53:02
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橘julia

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
算出来后，你会发现有一个对应的数据，分为两列吧，左侧从0到100，右侧是抑制剂浓度。因此只要找到数值50对应的抑制剂浓度就是IC50了
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12楼2012-09-11 20:18:56
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lillian2597

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这东西如果算出来，怎么分析啊
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13楼2016-02-27 10:52:39
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半梅若雪4

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by zqx1990 at 2012-07-09 21:34:52
我这里有一个我自己用VB做的IC50值计算器，输入浓度和抑制率就可以算出来。

能给我计算下吗？大神
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14楼2016-03-10 19:35:47
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二货的世界

新虫 (正式写手)
prism软件计算！！！

发自小木虫Android客户端
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15楼2016-03-10 19:52:08
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sy520911

新虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by xfdy at 2012-07-09 20:53:07
我们用的是sigmaplot计算 不过你的那个浓度梯度 不明白 你问你朋友呀

你好，我们用sigmplot计算，拟合曲线请问用哪个曲线？logarithm么？还是需要把y=c/1+expb(x-a)自定义代入？能不能指导我一下，谢谢了
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16楼2017-11-06 20:53:17
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yingying15886楼
2012-07-09 21:44   回复  
祝福~
ljqpyk7楼
2012-07-09 21:56   回复  
zhang731110楼
2012-07-11 13:37   回复  
zq553800559: 金币+1, 呵呵 2012-07-12 07:16:38
祝福!
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