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hustzju

木虫 (著名写手)

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[求助] 有坐标怎么看结构啊？

只有优化后的坐标，supporting information里只给了坐标，
怎么能看到结构？

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1楼 2012-07-06 16:06:52

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hustzju

木虫 (著名写手)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by Siriusgoul at 2012-07-06 19:08:11
嗯，最前面那行就是原子编号，一般要把它换成具体元素符号，改成xyz的最简单，其他还麻烦，比如：
29
Energy = -1126.741833063
C -5.1211966 -0.1227266 -1.0901835
C -3.8261712 -0.4316819 ...

只要换成元素符号就可以吗？
C                   2.208625 -0.236974 -0.051544
C                   1.925269 1.198495 -0.179844
C                0.690545 1.690312 -0.019408
C                -0.473454 0.808470 0.358213
C                -0.230135 -0.654483 0.140890
N                1.032546 -1.073025 0.105002
C                -1.850190 1.277727 -0.001033
C                -2.857332 0.395125 -0.191187
C                -2.591106 -1.016389 -0.139272
C                -1.328666 -1.536889 0.029420
O                3.285627 -0.773684 -0.094914
H                1.240278 -2.070505 0.058720
H                2.778553 1.825840 -0.412898
H                0.496631 2.756521 -0.098514
H                -0.517874 0.863587 1.475408
H             -2.022851 2.350254 -0.006126
H                -3.868253 0.735765 -0.387465
H             -3.421667 -1.704366 -0.273236
H                -1.158990 -2.608816 -0.008996