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hustzju

木虫 (著名写手)

[求助] 有坐标怎么看结构啊?

只有优化后的坐标,supporting information里只给了坐标,
怎么能看到结构?
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hustzju

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by Siriusgoul at 2012-07-06 19:08:11
嗯,最前面那行就是原子编号,一般要把它换成具体元素符号,改成xyz的最简单,其他还麻烦,比如:
29
Energy = -1126.741833063
C    -5.1211966   -0.1227266   -1.0901835
C    -3.8261712   -0.4316819    ...

只要换成元素符号就可以吗?
C                    2.208625   -0.236974   -0.051544
C                    1.925269    1.198495   -0.179844
C                   0.690545    1.690312   -0.019408
C                   -0.473454    0.808470    0.358213
C                  -0.230135   -0.654483    0.140890
N                   1.032546   -1.073025    0.105002
C                  -1.850190    1.277727   -0.001033
C                   -2.857332    0.395125   -0.191187
C                  -2.591106   -1.016389   -0.139272
C                  -1.328666   -1.536889    0.029420
O                   3.285627   -0.773684   -0.094914
H                   1.240278   -2.070505    0.058720
H                   2.778553    1.825840   -0.412898
H                  0.496631    2.756521   -0.098514
H                 -0.517874    0.863587    1.475408
H                -2.022851    2.350254   -0.006126
H                  -3.868253    0.735765   -0.387465
H                -3.421667   -1.704366   -0.273236
H                 -1.158990   -2.608816   -0.008996
8楼2012-07-06 19:52:04
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2012-07-06 17:25:02
用可视化软件,例如gaussview
2楼2012-07-06 16:12:45
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Siriusgoul

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2012-07-06 17:25:34
楼上正解……
看他给的坐标文件是什么格式,如果是.mol  .pdb .gjf .com 什么的GaussView都轻松搞定,还有类似于简单的.xyz格式的话chemcraft,DSviewPro也可应对,后面俩软件也挺好用的,可用于很多格式。
3楼2012-07-06 17:06:45
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hustzju

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gmy1990 at 2012-07-06 16:12:45
用可视化软件,例如gaussview

这个我知道啊,算完后用这个看吗问题的。
但现在是只有坐标数据,没有其他的,该怎么导入?
4楼2012-07-06 18:53:16
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