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yunxiao8252

铜虫 (小有名气)

[求助] ESI-QTOF测定多肽

用ESI源测定多肽后想要鉴定其实中的糖肽应该怎么确定,解卷积后得到的质量数可以认为是单电荷的吗?急需高人指点
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-06-29 18:24:52
yunxiao8252: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-06-30 09:37:29
解卷积之后的分子量就是你的多肽的实际分子量,只要不是荷质比的图,就不用考虑是不是单电荷。因为有多少电荷,解卷积过程已经帮你计算了。
再比对你的实际分子量,就知道是不是被糖基化了。
2楼2012-06-29 13:34:59
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yunxiao8252

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2012-06-29 13:34:59
解卷积之后的分子量就是你的多肽的实际分子量,只要不是荷质比的图,就不用考虑是不是单电荷。因为有多少电荷,解卷积过程已经帮你计算了。
再比对你的实际分子量,就知道是不是被糖基化了。

哦哦,好像明白了一些,不知大侠有没做过糖肽,嗯,由于实验室没有PNGase F等的糖链酶,所以没办法做对比,目前想到的是通过与文献中已经报道的糖肽进行对比分析,不过发现不同的文献中的报道会存在着一定的偏差,想问下偏差在多少范围内是可以接受的呢,因为我所检测到的部分分子量与之也存在着一定的偏差
3楼2012-06-30 09:37:06
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看天

木虫 (知名作家)

我想测定比如玉米浆里面的多肽怎么测定
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
4楼2012-07-12 13:06:21
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S0817010

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yunxiao8252: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-13 15:03:36
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助哦 2012-07-13 16:23:03
目前我在做糖蛋白结构方面的工作,据我调查到的文献,糖链具有不均一性,也就是说,不同组织产生同样的蛋白或,同种组织同种蛋白在不同时期被糖基化的结构都会有差别,因此,很难通过直接测糖蛋白的分子量来确定是哪种结构,而且所谓的去卷积,也只是你给了一个分子量范围,质谱软件给算出的结果,我始终相信,人才是最靠的住的,机器软件只是辅助功能,不知道楼主的结果如何,我这边的结果不是一个数据,当然,这跟我样品的性质有关。另外,看楼主的糖蛋白是何种形式的连接,是N-还是O-链接,目前应用最多的是用各种方法去除糖基,以排除其不确定性。当然,看你是什么目的,是要测糖连接位点,还是测蛋白序列,抑或是测糖链结构,或糖含量,不同目的有不同方法,需楼主研究相关资料。
做个秒针,也挺好的
5楼2012-07-12 18:05:17
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yunxiao8252

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by S0817010 at 2012-07-12 18:05:17
目前我在做糖蛋白结构方面的工作,据我调查到的文献,糖链具有不均一性,也就是说,不同组织产生同样的蛋白或,同种组织同种蛋白在不同时期被糖基化的结构都会有差别,因此,很难通过直接测糖蛋白的分子量来确定是哪 ...

我做的是HRP的标准品,目前采取的办法是根据文献的报道对比于分子量
6楼2012-07-13 15:01:42
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yunxiao8252

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 看天 at 2012-07-12 13:06:21
我想测定比如玉米浆里面的多肽怎么测定

抱歉,我也是新手,呵呵,实际样我只做过人血清的,凝胶电泳分离后胶内酶解再测
7楼2012-07-13 15:03:06
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