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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » castep吸附数据分析问题
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nan1026feng

木虫 (小有名气)

[求助] castep吸附数据分析问题

请问下大家：
1.由于吸附后，构型重构，很多原子位置已经乱了，当初在一层的原子现在也不在一个平面了，这种情况下如何吸附弛豫后各个表面层的层间距呢？
2.吸附原子到第一层表面原子的垂直距离又怎么求呢？（最初我以为就是Z坐标之差，但后来才发现这样求明显是错的，因为坐标轴XYZ是当初晶胞的坐标轴，并非以真空层方向为Z轴，另外由于第一层原子似乎已经不在一个平面了，这个距离能求吗，如果要求的话，该怎么求呢）
    我看到文献上很多都求了吸附弛豫后层间距相对体相的变化，并分析弛豫后构型是膨胀还是收缩，另外也求了吸附原子或分子到表面的距离，这个又是怎么求的呢？大家有遇到吸附弛豫后原子错位严重不在一层的问题吗？这种问题大家又是怎么处理的呢？这个问题我纠结好久了啊，麻烦大家知道的帮帮忙啊，拜托了
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1楼 2012-06-24 13:01:21
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houfeifan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-25 07:59:39
nan1026feng: 金币+3, ★有帮助, 谢谢你，我试试看哈 2012-06-25 19:01:30
引用回帖:
2楼: Originally posted by nan1026feng at 2012-06-24 14:48:32
诶，都没得人回啊，自己顶一下了

感觉你把问题想复杂了，其实你考虑同一种原子的沿着z方向的间距变化就行了，不要完全拘泥于面与面的层间距，因为重构之后表面原子多半不在一个平面的。
   至于分子距离表面的距离，通常你要考虑的是具体的吸附位，继而计算分子到这个吸附位的距离。
   仅供参考。
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3楼2012-06-24 19:26:01
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nan1026feng

木虫 (小有名气)
诶，都没得人回啊，自己顶一下了
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2楼2012-06-24 14:48:32
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nan1026feng

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by houfeifan at 2012-06-24 19:26:01
感觉你把问题想复杂了，其实你考虑同一种原子的沿着z方向的间距变化就行了，不要完全拘泥于面与面的层间距，因为重构之后表面原子多半不在一个平面的。
   至于分子距离表面的距离，通常你要考虑的是具体的吸附位 ...

嗯，谢谢你啦，你说的有道理啊，就是说啊，那难道说就不求面与面的层间距了？只考虑分子到这个吸附位的距离？我是想计算哈层与层的距离？除了这个还能用其他方式来计算层与层的距离吗？
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4楼2012-06-25 19:00:59
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franch

版主 (著名写手)
建议上图。。。  不清楚你说的乱了有多乱，，
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遇弱则弱
5楼2012-06-25 21:36:53
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