24小时热门版块排行榜    

查看: 959  |  回复: 2

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 急问pdb文件默认的segid是多少呀?

使用namd时,使用patch命令修改残基的质子化状态时,pgn文件中的patch命令不会写,不知道其中的参数segid应该填什么?

user guide中patch命令的格式是
patch
    {……}
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-17 20:36:03
个人认为,可以忽视
segid 只是segment的序列号,对模拟没有什么影响。
2楼2012-06-17 20:28:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longshuj

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhongshun: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2012-06-21 11:32:09
个人认为有影响,经验share:在写pgn文件中的segment语句时会重新定义segid的
仅供参考!
3楼2012-06-21 11:23:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhongshun 的主题更新
信息提示
请填处理意见