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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 大家帮忙看看提取土壤DNA
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dayunihao

银虫 (初入文坛)

[求助] 大家帮忙看看提取土壤DNA

我是个新手，用周集中文献的方法提取土壤DNA，没有任何的改动，提取到的DNA浅黄色，有点褐色的杂质，跑胶图如下，请大家指点一下是什么原因呢？
我做改进，提取好的DNA要拿去测序啊，老板催的急，着急啊……
还有就是加完抽提液（PH=8)和SDS(pH=7.2)离心后也会产生很多的悬浮物，不知大家提取时有没有出现啊？是我的溶液配制的浓度不够吗？

前3个条带是我用周集中文献的方法提的3个样品（编号123），后面八个条带是我用fastDNA试剂盒提取（编号1，1，2，2，2，3，3，3）
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1楼 2012-06-16 12:15:44
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dayunihao: 金币+30, ★有帮助 2012-06-17 10:28:37
提取失败了. 好的DNA应该是一条大概23KB的细带.
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请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2012-06-16 15:40:19
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zhenjiangjin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1 说法明显不对，总DNA怎能拿去测序？
2 现在总DNA提取都用试剂盒了，MO BIO Laboratories的PowerSoil就很好用，小量中量大量都有，价钱也还能接受。提取出来的也是1条带。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-06-16 21:05:32
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普通回帖

380632468
2楼2012-06-16 12:18:49
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shiyaox1
3楼2012-06-16 12:24:47
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张焕霞

金虫 (正式写手)
不知道  帮不了你
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4楼2012-06-16 12:36:49
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张俊亚

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看着全像是RNA，肯定不是你要的总DNA！
中文的文献都不怎么可靠！好的提取方法还是去外文上面去找！
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7楼2012-06-17 10:29:58
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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhenjiangjin at 2012-06-16 21:05:32
1 说法明显不对，总DNA怎能拿去测序？
2 现在总DNA提取都用试剂盒了，MO BIO Laboratories的PowerSoil就很好用，小量中量大量都有，价钱也还能接受。提取出来的也是1条带。

总DNA 可以测序啊。。
打成片段随机引物 454.。
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8楼2012-06-17 11:03:39
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhenjiangjin at 2012-06-16 21:05:32
1 说法明显不对，总DNA怎能拿去测序？
2 现在总DNA提取都用试剂盒了，MO BIO Laboratories的PowerSoil就很好用，小量中量大量都有，价钱也还能接受。提取出来的也是1条带。

MO BIO质量也不稳定,去年有一段时间他们还回收了试剂盒,因为离心柱质量不好的原因.
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请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
9楼2012-06-17 11:38:44
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)
★ ★ ★
scelab: 金币+3, 谢谢回复哦~ 2012-06-17 11:45:01
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhenjiangjin at 2012-06-16 21:05:32
1 说法明显不对，总DNA怎能拿去测序？
2 现在总DNA提取都用试剂盒了，MO BIO Laboratories的PowerSoil就很好用，小量中量大量都有，价钱也还能接受。提取出来的也是1条带。

总DNA可以拿去PYROSEQUENCING.不过最好还是PCR扩增之后再用454或illumina测序.
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请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
10楼2012-06-17 11:39:38
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