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这样的序列比对结果在基因组中的拷贝数是1个还是2个？
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Sample Text这样的比对结果表明，序列在基因组中的拷贝数，是1个还是2个？都在2号染色体，怎么判断是1个拷贝还是2个拷贝？这两个参考序列难道是同一条序列？ 为什么在参考序列1（ref|NT_005403.17）中，该序列在18703 bp at 5' side Hox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 而在参考序列2（ref|NW_001838863.1）中，该序列在18699 bp at 5' sideHox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 blast hits 有2条：显示如下： 两条序列都100%比对上， （1）>ref|NT_005403.17|  Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh37.p5 Primary AssemblyLength=84213159Features flanking this part of subject sequence: 18703 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus （2）>ref|NW_001838863.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, alternate assembly HuRef SCAF_1103279188396, whole genome shotgun sequenceLength=44081246 Features flanking this part of subject sequence: 18699 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus |
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