| 查看: 1096 | 回复: 0 | |||
[交流]
这样的序列比对结果在基因组中的拷贝数是1个还是2个？
|
|
Sample Text这样的比对结果表明，序列在基因组中的拷贝数，是1个还是2个？都在2号染色体，怎么判断是1个拷贝还是2个拷贝？这两个参考序列难道是同一条序列？ 为什么在参考序列1（ref|NT_005403.17）中，该序列在18703 bp at 5' side Hox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 而在参考序列2（ref|NW_001838863.1）中，该序列在18699 bp at 5' sideHox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 blast hits 有2条：显示如下： 两条序列都100%比对上， （1）>ref|NT_005403.17|  Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh37.p5 Primary AssemblyLength=84213159Features flanking this part of subject sequence: 18703 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus （2）>ref|NW_001838863.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, alternate assembly HuRef SCAF_1103279188396, whole genome shotgun sequenceLength=44081246 Features flanking this part of subject sequence: 18699 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus |
回复此楼» 猜你喜欢
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有181人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
手提基因组方法遇到的问题
已经有12人回复
- 【资料】番茄基因组完成测序（附Nature全文）
已经有73人回复
- 哪位大神来指导下数字信号处理怎么学，感激不尽
已经有30人回复
- 序列比对不上？怎么办？
已经有7人回复
- 23Kb大小的基因组DNA完整性检测时琼脂糖电泳相关条件
已经有5人回复
- 提取植物组织中的微生物基因组
已经有4人回复
- 新手：请问怎么查找质粒全基因组序列，pRR88，psp72,pcDNA3.1
已经有8人回复
- southern杂交检测基因拷贝数的原理是什么？
已经有19人回复
- real time PCR能测定基因组内某一基因的拷贝数吗？
已经有4人回复
- 【求助/交流】如何通过一个基因组序列获得启动子？
已经有3人回复
- 【求助/交流】寻找基因组序列中的单拷贝基因
已经有8人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
50