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xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)

[求助] 求助关于过渡态搜索中遇到的问题

本人刚学ms没多久,在用dmol进行过渡态搜索,也确实提示计算成功了,可我看过渡态的结构和我假设的产物结构差不多,只是一个角度有所变化,请问我这个结构算是过渡态么?而且得到的过渡态有两个虚频,一个-1500左右,是我想要的,另一个-30左右,不是我想要的,该如何去消除?有人提到用ts confirmation进行过渡态确认,这个confirmation的具体作用或者说计算结果怎么分析?求高手解答,谢谢啦!!!
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Lathander

新虫 (小有名气)

1. 2个imaginary frequency不是saddle point,saddle point数学上的定义很严格
2. 和产物初始态差别不大倒不是问题,TS本来就可以偏向IS或者FS,尤其是表面吸附的计算中。请参看Sholl DS几年前关于手性分子吸附paper里面的描述
3楼2012-10-30 11:59:02
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