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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » split_dos分割以后，如何找到对应的原子？
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liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] split_dos分割以后，如何找到对应的原子？

第一次使用split_dos，我总共有76个原子，其中1-72号为二氧化钛的一个二维晶面，73-76为吸附在上面的4个金属原子形成的团簇。
1.我如何选择数据呢？是不是把所有的O的P轨道，Ti的d轨道和Pt的d轨道画出来？
2.我是用MS构建的模型，如果我只想看看与金属团簇发生作用的原子，我如何找出其对应的原子序号呢？
万分感谢！
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1楼 2012-06-13 10:14:02
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
liufeila: 金币+6, ★★★很有帮助 2012-06-14 11:01:53
引用回帖:
10楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-14 10:06:57
我看了DOSCAR里面前面有几行是5列数据，后面的全部是19列数据，我怀疑是split-dos自动把数据只分割成s,p,d自旋向上，向下，因为我做的图跟band图完全能对应。分析dos图也觉得是正确的，你的意见呢？...

如果是19列那就应该没啥问题，s、p、d自旋向上、向下加一块儿正好9*2=18，可能是你处理的时候出了问题
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11楼2012-06-14 10:53:36
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的指导 2012-06-13 13:51:24
根据POSCAR或者OUTCAR来确定，首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置，根据坐标去确定原子序号
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2楼2012-06-13 10:18:34
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liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:18:34
根据POSCAR或者OUTCAR来确定，首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置，根据坐标去确定原子序号

MS上显而易见，就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来，这样找会不会很麻烦？
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3楼2012-06-13 10:24:07
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liufeila: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-06-13 10:41:20
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-14 10:16:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:24:07
MS上显而易见，就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来，这样找会不会很麻烦？...

OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀，你能确定坐标，回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多，话说这个也不算麻烦吧
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4楼2012-06-13 10:29:26
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