24小时热门版块排行榜    

查看: 2150  |  回复: 11

liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] split_dos分割以后,如何找到对应的原子?

第一次使用split_dos,我总共有76个原子,其中1-72号为二氧化钛的一个二维晶面,73-76为吸附在上面的4个金属原子形成的团簇。
1.我如何选择数据呢?是不是把所有的O的P轨道,Ti的d轨道和Pt的d轨道画出来?
2.我是用MS构建的模型,如果我只想看看与金属团簇发生作用的原子,我如何找出其对应的原子序号呢?
万分感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的指导 2012-06-13 13:51:24
根据POSCAR或者OUTCAR来确定,首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置,根据坐标去确定原子序号
2楼2012-06-13 10:18:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:18:34
根据POSCAR或者OUTCAR来确定,首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置,根据坐标去确定原子序号

MS上显而易见,就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来,这样找会不会很麻烦?
3楼2012-06-13 10:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liufeila: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-06-13 10:41:20
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-14 10:16:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:24:07
MS上显而易见,就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来,这样找会不会很麻烦?...

OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀,你能确定坐标,回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多,话说这个也不算麻烦吧
4楼2012-06-13 10:29:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:29:26
OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀,你能确定坐标,回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多,话说这个也不算麻烦吧...

再有一个问题,这样找出来的原子对应的态密度有意义吗?另,我看了下我所有原子都有7列数据,第一列为能量的话,后面六列是否分别对应s 自旋向上 ,向下,p自旋向上,行下,d自旋向上,向下?
5楼2012-06-13 10:43:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


WDD880227: 金币+1, 感谢提示 2012-06-14 08:42:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:43:04
再有一个问题,这样找出来的原子对应的态密度有意义吗?另,我看了下我所有原子都有7列数据,第一列为能量的话,后面六列是否分别对应s 自旋向上 ,向下,p自旋向上,行下,d自旋向上,向下?...

我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊
6楼2012-06-13 15:40:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

开了的,我设置了ISPIN=2的。
7楼2012-06-13 17:07:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

我觉得可能是split-dos的问题,这个程序有bug,但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢
8楼2012-06-13 17:21:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 17:21:10
我觉得可能是split-dos的问题,这个程序有bug,但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢...

你看一下DOSCAR里面的数据是几列?
9楼2012-06-13 17:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 17:33:53
你看一下DOSCAR里面的数据是几列?...

我看了DOSCAR里面前面有几行是5列数据,后面的全部是19列数据,我怀疑是split-dos自动把数据只分割成s,p,d自旋向上,向下,因为我做的图跟band图完全能对应。分析dos图也觉得是正确的,你的意见呢?
10楼2012-06-14 10:06:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liufeila 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +41 医学老男孩 2026-08-13 94/4700 2026-08-18 10:20 by 医学老男孩
[论文投稿] 投稿咨询 +3 wwm09 2026-08-17 4/200 2026-08-18 09:52 by xs74101122
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +4 基诺咪客 2026-08-17 5/250 2026-08-18 08:03 by 基诺咪客
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见