应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » split_dos分割以后，如何找到对应的原子？
121/2返回列表12下一页
查看: 2383  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] split_dos分割以后，如何找到对应的原子？

第一次使用split_dos，我总共有76个原子，其中1-72号为二氧化钛的一个二维晶面，73-76为吸附在上面的4个金属原子形成的团簇。
1.我如何选择数据呢？是不是把所有的O的P轨道，Ti的d轨道和Pt的d轨道画出来？
2.我是用MS构建的模型，如果我只想看看与金属团簇发生作用的原子，我如何找出其对应的原子序号呢？
万分感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-06-13 10:14:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的指导 2012-06-13 13:51:24
根据POSCAR或者OUTCAR来确定，首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置，根据坐标去确定原子序号
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-13 10:18:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:18:34
根据POSCAR或者OUTCAR来确定，首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置，根据坐标去确定原子序号

MS上显而易见，就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来，这样找会不会很麻烦？
赞一下 回复此楼
3楼2012-06-13 10:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liufeila: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-06-13 10:41:20
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-14 10:16:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:24:07
MS上显而易见，就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来，这样找会不会很麻烦？...

OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀，你能确定坐标，回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多，话说这个也不算麻烦吧
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-13 10:29:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:29:26
OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀，你能确定坐标，回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多，话说这个也不算麻烦吧...

再有一个问题，这样找出来的原子对应的态密度有意义吗？另，我看了下我所有原子都有7列数据，第一列为能量的话，后面六列是否分别对应s 自旋向上 ，向下，p自旋向上，行下，d自旋向上，向下？
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-13 10:43:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
WDD880227: 金币+1, 感谢提示 2012-06-14 08:42:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:43:04
再有一个问题，这样找出来的原子对应的态密度有意义吗？另，我看了下我所有原子都有7列数据，第一列为能量的话，后面六列是否分别对应s 自旋向上 ，向下，p自旋向上，行下，d自旋向上，向下？...

我感觉你这个态密度还是有问题的，你计算的时候自旋开了没有？除了第一列，剩下的六列也对应不上，因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊
赞一下 回复此楼
6楼2012-06-13 15:40:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的，你计算的时候自旋开了没有？除了第一列，剩下的六列也对应不上，因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

开了的，我设置了ISPIN=2的。
赞一下 回复此楼
7楼2012-06-13 17:07:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的，你计算的时候自旋开了没有？除了第一列，剩下的六列也对应不上，因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

我觉得可能是split-dos的问题，这个程序有bug，但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢
赞一下 回复此楼
8楼2012-06-13 17:21:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 17:21:10
我觉得可能是split-dos的问题，这个程序有bug，但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢...

你看一下DOSCAR里面的数据是几列？
赞一下 回复此楼
9楼2012-06-13 17:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 17:33:53
你看一下DOSCAR里面的数据是几列？...

我看了DOSCAR里面前面有几行是5列数据，后面的全部是19列数据，我怀疑是split-dos自动把数据只分割成s,p,d自旋向上，向下，因为我做的图跟band图完全能对应。分析dos图也觉得是正确的，你的意见呢？
赞一下 回复此楼
10楼2012-06-14 10:06:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liufeila 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 1Nb0IVlmV6v0 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:23 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 8/400 2026-11-12 06:58 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:58 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:47 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 06:45 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:39 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:36 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 06:36 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 4/200 2026-11-12 06:28 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-12 05:41 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 05:22 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:11 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +7 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 11/550 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 04:57 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 5/250 2026-11-12 01:17 by 9fOTqj074tIg
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭