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liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] split_dos分割以后,如何找到对应的原子?

第一次使用split_dos,我总共有76个原子,其中1-72号为二氧化钛的一个二维晶面,73-76为吸附在上面的4个金属原子形成的团簇。
1.我如何选择数据呢?是不是把所有的O的P轨道,Ti的d轨道和Pt的d轨道画出来?
2.我是用MS构建的模型,如果我只想看看与金属团簇发生作用的原子,我如何找出其对应的原子序号呢?
万分感谢!
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的指导 2012-06-13 13:51:24
根据POSCAR或者OUTCAR来确定,首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置,根据坐标去确定原子序号
2楼2012-06-13 10:18:34
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liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:18:34
根据POSCAR或者OUTCAR来确定,首先确定与金属团簇发生作用的原子的位置,根据坐标去确定原子序号

MS上显而易见,就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来,这样找会不会很麻烦?
3楼2012-06-13 10:24:07
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
liufeila: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-06-13 10:41:20
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-14 10:16:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:24:07
MS上显而易见,就是不知道如何把坐标跟原子序号对应起来,这样找会不会很麻烦?...

OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀,你能确定坐标,回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多,话说这个也不算麻烦吧
4楼2012-06-13 10:29:26
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liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 10:29:26
OUTCAR里面有各个原子的坐标以及对应的原子序号呀,你能确定坐标,回到OUTCARl里面对应起来就是了。发生作用的原子又不是很多,话说这个也不算麻烦吧...

再有一个问题,这样找出来的原子对应的态密度有意义吗?另,我看了下我所有原子都有7列数据,第一列为能量的话,后面六列是否分别对应s 自旋向上 ,向下,p自旋向上,行下,d自旋向上,向下?
5楼2012-06-13 10:43:04
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


WDD880227: 金币+1, 感谢提示 2012-06-14 08:42:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 10:43:04
再有一个问题,这样找出来的原子对应的态密度有意义吗?另,我看了下我所有原子都有7列数据,第一列为能量的话,后面六列是否分别对应s 自旋向上 ,向下,p自旋向上,行下,d自旋向上,向下?...

我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊
6楼2012-06-13 15:40:03
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liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

开了的,我设置了ISPIN=2的。
7楼2012-06-13 17:07:11
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liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 15:40:03
我感觉你这个态密度还是有问题的,你计算的时候自旋开了没有?除了第一列,剩下的六列也对应不上,因为考虑s和p的自旋应该有8列才对。你查一下看看是什么原因啊...

我觉得可能是split-dos的问题,这个程序有bug,但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢
8楼2012-06-13 17:21:10
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xueht987

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liufeila at 2012-06-13 17:21:10
我觉得可能是split-dos的问题,这个程序有bug,但是我画图出来跟PVvasp没啥明显的差异呢...

你看一下DOSCAR里面的数据是几列?
9楼2012-06-13 17:33:53
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liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xueht987 at 2012-06-13 17:33:53
你看一下DOSCAR里面的数据是几列?...

我看了DOSCAR里面前面有几行是5列数据,后面的全部是19列数据,我怀疑是split-dos自动把数据只分割成s,p,d自旋向上,向下,因为我做的图跟band图完全能对应。分析dos图也觉得是正确的,你的意见呢?
10楼2012-06-14 10:06:57
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