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alexwpch

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误

尝试使用高斯研究金属离子与氯苯的相互作用，在结构优化的时候始终没有结果，出现各种错误，主要是收敛问题。而且经过优化后有的金属离子和氯苯会离得很远，这是初始构型不正确吗，需要如何改动。
将各种错误的输入和输出文件上传，请各位专业人士帮忙分析下，重新提供些输入方法。本人不是理论计算出身，所以可能会有些低级错误，大家轻喷。其中有个唯一运行正确的文件。[ Last edited by alexwpch on 2012-6-11 at 12:15 ]
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  • 附件 1 : Fe-right.out
    • 2012-06-11 10:41:07, 764.22 K
  • 附件 2 : Nb-L502.out
    • 2012-06-11 10:41:16, 579.93 K
  • 附件 3 : Nb-L9999.out
    • 2012-06-11 10:41:19, 609.11 K
  • 附件 4 : Ti-L9999.out
    • 2012-06-11 10:41:25, 754.43 K
  • 附件 5 : Nb.gjf
    • 2012-06-11 10:41:32, 1.06 K
  • 附件 6 : Ti.gjf
    • 2012-06-11 10:41:46, 1.02 K
  • 附件 7 : Zr-L103.out
    • 2012-06-11 12:15:21, 755.39 K

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1楼 2012-06-11 10:45:09
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alexwpch

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Mr_WuSH at 2012-06-12 08:11:05
我觉得你可以用Fragment来优化试一试。不熟悉先不要用link，一步一步来·····
（下面的坐标是乱写的··可能跟你的不一样······，只是说一下Fragment的格式··）
# ···············  C ...

试了你的方法，还是不收敛，L502错误。
输入文件如下:
# opt=(cartesian) uhf/genecp Counterpoise=2

Zr

4,1 0,1 4,1
C(Fragment=1)                     1.13913  -0.12117  -0.3112
C(Fragment=1)                     2.45988  -0.4199    0.04978
C(Fragment=1)                     3.34451   0.613     0.38812
C(Fragment=1)                     2.90839   1.94462   0.36548
C(Fragment=1)                     1.58764   2.24334   0.0045
C(Fragment=1)                     0.70301   1.21044  -0.33384
H(Fragment=1)                     0.4637   -0.90981  -0.56953
H(Fragment=1)                     2.79287  -1.43662   0.06706
H(Fragment=1)                     4.35294   0.38492   0.66373
H(Fragment=1)                     3.58383   2.73326   0.6238
H(Fragment=1)                     1.25466   3.26006  -0.01279
Cl(Fragment=1)                   -0.9557    1.58561  -0.7872
Zr(Fragment=2)                   -2.41086  -0.26799  -0.15452

Zr 0
Lanl2DZ
****
C H 0
3-21G
****
Cl 0
6-311G**(d,p)
****

Zr 0
Lanl2DZ
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5楼2012-06-12 18:43:07
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Mr_WuSH

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
alexwpch: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢哈，我试试这个方法看，先送你20金币，再没人回复的话剩下的都给你。 2012-06-12 09:09:13
gmy1990: 金币+2 2012-06-12 09:22:02
我觉得你可以用Fragment来优化试一试。不熟悉先不要用link，一步一步来·····
（下面的坐标是乱写的··可能跟你的不一样······，只是说一下Fragment的格式··）
# ···············  Counterpoise=2

   X   

0 1
C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +0.00000000
C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +1.39516000
C(Fragment=1) +1.20775100 +0.00000000 +2.09269800
C(Fragment=1) +2.41626000 -0.00119900 +1.39504400
C(Fragment=1) +2.41618200 -0.00167800 +0.00021900
C(Fragment=1) +1.20797600 -0.00068200 -0.69738200
H(Fragment=1) -0.95231700 +0.00045000 -0.54975900
H(Fragment=1) -0.95251300 +0.00131500 +1.94466800
H(Fragment=1) +1.20783100 +0.00063400 +3.19237800
H(Fragment=1) +3.36840300 -0.00125800 +1.94524400
H(Fragment=1) +3.36846301 -0.00262292 -0.54990300
H(Fragment=1) +1.20815900 -0.00086200 -1.79698600
H(Fragment=2) +1.28409831 +1.81161709 +0.70347558
Ti(Fragment=2) +1.33116591 +2.91011442 +0.68530890
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2楼2012-06-12 08:11:05
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meteoric30

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
alexwpch: 金币+5, ★有帮助, 不只是L502，还有L9999等，还有其他金属离子也是一样的错误。我试着加maxcyc=200，这种情况容易出现L9999错误，qc没加过。 2012-06-12 10:32:47
2楼说的是bsse吧~~你如果主要是~收敛（l502）的问题的话，主要还是自洽场不收敛，在含fe的物质中计算 常见错误，加上（maxcycle=300，xqc）或者qc掉 比较合适~~
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3楼2012-06-12 09:25:05
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meteoric30

木虫 (正式写手)
★
gmy1990: 金币+1, 3X 2012-06-12 20:14:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by meteoric30 at 2012-06-12 09:25:05
2楼说的是bsse吧~~你如果主要是~收敛（l502）的问题的话，主要还是自洽场不收敛，在含fe的物质中计算 常见错误，加上（maxcycle=300，xqc）或者qc掉 比较合适~~

999不是错 最后一个拉出去 继续算 就行了 maxcycle 最好300比较合适
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4楼2012-06-12 10:35:30
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