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alexwpch木虫 (正式写手)
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高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误
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尝试使用高斯研究金属离子与氯苯的相互作用，在结构优化的时候始终没有结果，出现各种错误，主要是收敛问题。而且经过优化后有的金属离子和氯苯会离得很远，这是初始构型不正确吗，需要如何改动。 将各种错误的输入和输出文件上传，请各位专业人士帮忙分析下，重新提供些输入方法。本人不是理论计算出身，所以可能会有些低级错误，大家轻喷。其中有个唯一运行正确的文件。[ Last edited by alexwpch on 2012-6-11 at 12:15 ] |
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alexwpch: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢哈，我试试这个方法看，先送你20金币，再没人回复的话剩下的都给你。 2012-06-12 09:09:13
gmy1990: 金币+2 2012-06-12 09:22:02
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我觉得你可以用Fragment来优化试一试。不熟悉先不要用link，一步一步来····· （下面的坐标是乱写的··可能跟你的不一样······，只是说一下Fragment的格式··） # ··············· Counterpoise=2 X 0 1 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +0.00000000 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +1.39516000 C(Fragment=1) +1.20775100 +0.00000000 +2.09269800 C(Fragment=1) +2.41626000 -0.00119900 +1.39504400 C(Fragment=1) +2.41618200 -0.00167800 +0.00021900 C(Fragment=1) +1.20797600 -0.00068200 -0.69738200 H(Fragment=1) -0.95231700 +0.00045000 -0.54975900 H(Fragment=1) -0.95251300 +0.00131500 +1.94466800 H(Fragment=1) +1.20783100 +0.00063400 +3.19237800 H(Fragment=1) +3.36840300 -0.00125800 +1.94524400 H(Fragment=1) +3.36846301 -0.00262292 -0.54990300 H(Fragment=1) +1.20815900 -0.00086200 -1.79698600 H(Fragment=2) +1.28409831 +1.81161709 +0.70347558 Ti(Fragment=2) +1.33116591 +2.91011442 +0.68530890 |
2楼2012-06-12 08:11:05
meteoric30
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4楼2012-06-12 10:35:30
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试了你的方法，还是不收敛，L502错误。 输入文件如下: # opt=(cartesian) uhf/genecp Counterpoise=2 Zr 4,1 0,1 4,1 C(Fragment=1) 1.13913 -0.12117 -0.3112 C(Fragment=1) 2.45988 -0.4199 0.04978 C(Fragment=1) 3.34451 0.613 0.38812 C(Fragment=1) 2.90839 1.94462 0.36548 C(Fragment=1) 1.58764 2.24334 0.0045 C(Fragment=1) 0.70301 1.21044 -0.33384 H(Fragment=1) 0.4637 -0.90981 -0.56953 H(Fragment=1) 2.79287 -1.43662 0.06706 H(Fragment=1) 4.35294 0.38492 0.66373 H(Fragment=1) 3.58383 2.73326 0.6238 H(Fragment=1) 1.25466 3.26006 -0.01279 Cl(Fragment=1) -0.9557 1.58561 -0.7872 Zr(Fragment=2) -2.41086 -0.26799 -0.15452 Zr 0 Lanl2DZ **** C H 0 3-21G **** Cl 0 6-311G**(d,p) **** Zr 0 Lanl2DZ |
5楼2012-06-12 18:43:07
alexwpch
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不懂BSSE，我基本是自学的，从最简单的烷基苯的电子云密度开始学起，现在想进一步。小卒的faq看过，但是没全搞懂。不懂得只能先放一边，什么时候用了，什么时候再看。而且，我是有机合成的，实验为主，大部分时间需要做实验和看相关文献。 PS：终于知道为什么一些较有名的有机课题组都需要专门的做量化计算的人了。一个人同时学，做，看两个方向很是痛苦啊，而且量化还是没人指导，只能自己摸索。 再PS：我前面发过一个求助贴，请人帮我用G2或G3算一个小分子的生成热，不知道你能不能帮下忙。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4576382 |
8楼2012-06-12 20:30:32
beefly
专家顾问 (职业作家)
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9楼2012-06-13 00:34:56
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10楼2012-06-13 08:43:53
