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alexwpch木虫 (正式写手)
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高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误
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尝试使用高斯研究金属离子与氯苯的相互作用,在结构优化的时候始终没有结果,出现各种错误,主要是收敛问题。而且经过优化后有的金属离子和氯苯会离得很远,这是初始构型不正确吗,需要如何改动。 将各种错误的输入和输出文件上传,请各位专业人士帮忙分析下,重新提供些输入方法。本人不是理论计算出身,所以可能会有些低级错误,大家轻喷。其中有个唯一运行正确的文件。[ Last edited by alexwpch on 2012-6-11 at 12:15 ] |
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meteoric30
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3楼2012-06-12 09:25:05
Mr_WuSH
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【答案】应助回帖
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alexwpch: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢哈,我试试这个方法看,先送你20金币,再没人回复的话剩下的都给你。 2012-06-12 09:09:13
gmy1990: 金币+2 2012-06-12 09:22:02
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alexwpch: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢哈,我试试这个方法看,先送你20金币,再没人回复的话剩下的都给你。 2012-06-12 09:09:13
gmy1990: 金币+2 2012-06-12 09:22:02
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我觉得你可以用Fragment来优化试一试。不熟悉先不要用link,一步一步来····· (下面的坐标是乱写的··可能跟你的不一样······,只是说一下Fragment的格式··) # ··············· Counterpoise=2 X 0 1 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +0.00000000 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +1.39516000 C(Fragment=1) +1.20775100 +0.00000000 +2.09269800 C(Fragment=1) +2.41626000 -0.00119900 +1.39504400 C(Fragment=1) +2.41618200 -0.00167800 +0.00021900 C(Fragment=1) +1.20797600 -0.00068200 -0.69738200 H(Fragment=1) -0.95231700 +0.00045000 -0.54975900 H(Fragment=1) -0.95251300 +0.00131500 +1.94466800 H(Fragment=1) +1.20783100 +0.00063400 +3.19237800 H(Fragment=1) +3.36840300 -0.00125800 +1.94524400 H(Fragment=1) +3.36846301 -0.00262292 -0.54990300 H(Fragment=1) +1.20815900 -0.00086200 -1.79698600 H(Fragment=2) +1.28409831 +1.81161709 +0.70347558 Ti(Fragment=2) +1.33116591 +2.91011442 +0.68530890 |
2楼2012-06-12 08:11:05
meteoric30
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试了你的方法,还是不收敛,L502错误。 输入文件如下: # opt=(cartesian) uhf/genecp Counterpoise=2 Zr 4,1 0,1 4,1 C(Fragment=1) 1.13913 -0.12117 -0.3112 C(Fragment=1) 2.45988 -0.4199 0.04978 C(Fragment=1) 3.34451 0.613 0.38812 C(Fragment=1) 2.90839 1.94462 0.36548 C(Fragment=1) 1.58764 2.24334 0.0045 C(Fragment=1) 0.70301 1.21044 -0.33384 H(Fragment=1) 0.4637 -0.90981 -0.56953 H(Fragment=1) 2.79287 -1.43662 0.06706 H(Fragment=1) 4.35294 0.38492 0.66373 H(Fragment=1) 3.58383 2.73326 0.6238 H(Fragment=1) 1.25466 3.26006 -0.01279 Cl(Fragment=1) -0.9557 1.58561 -0.7872 Zr(Fragment=2) -2.41086 -0.26799 -0.15452 Zr 0 Lanl2DZ **** C H 0 3-21G **** Cl 0 6-311G**(d,p) **** Zr 0 Lanl2DZ |
5楼2012-06-12 18:43:07













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