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shui449

银虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学计算

想向大家请教一下,做分子动力学计算后,能量模拟随时间的变化曲线是怎么得到的?
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shui449

银虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by xhzha at 2012-06-08 13:07:55
这是linux常用命令吧,我相信你跑分子动力学应该是在大型服务器上跑,连接服务器肯定是通过shell窗口吧,直接在out文件所在目录,例如你想搜索有energy关键词的行,写到一个dat文件里,你可以写:grep 'energy' sy ...

谢谢你的帮助,我用的是castep进行分子动力学计算,用putty来提交作业,我试了一下grep命令还是不行
12楼2012-06-08 16:34:55
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

迅速收敛至一个稳定值
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
2楼2012-06-06 16:37:15
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shui449

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-06-06 16:37:15
迅速收敛至一个稳定值

不明白你的意思
3楼2012-06-06 17:06:05
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iamikaruk

木虫 (著名写手)


xueht987: , 谢谢回帖! 2012-06-07 12:50:48
WDD880227: 金币+1, 感谢提示 2012-06-07 16:54:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by shui449 at 2012-06-06 17:06:05
不明白你的意思...

如果你的计算参数设置合理的话,会收敛到一个固定的能量值
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
4楼2012-06-06 18:19:52
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