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YJD落叶梧桐

新虫 (小有名气)

[求助] 限制性内切酶图谱的确定

我有一未知的病毒,我已进行了多个单酶切,现在准备进行双酶切来进行酶切位点的定位,可是我不知道怎么来确定,顺便说一下,我的病毒可是超螺旋的,请问有哪为楼主知道,帮帮忙啊!
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yyhheda

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


YJD落叶梧桐: 金币+1 2012-06-09 21:24:42
可以全基因组测序啊,楼主是那种类型的病毒,现在高通量测序挺便宜的,测完就都知道了
2楼2012-06-08 21:56:56
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YJD落叶梧桐

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yyhheda at 2012-06-08 21:56:56
可以全基因组测序啊,楼主是那种类型的病毒,现在高通量测序挺便宜的,测完就都知道了

我的病毒全基因组有30-40kb左右,测序费用高,导师不同意,所以希望有更好的方法,其实他是想让我用单酶切和双酶切相结合的方法来验证,可是我还是不能分析出来
3楼2012-06-09 21:29:11
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chibang1220

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

那工作量够大的啊,祝福楼主
人的差别在于业余时间
4楼2012-06-09 21:43:08
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yyhheda

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
YJD落叶梧桐: 金币+1, 有帮助 2012-06-11 07:40:23
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-06-12 13:38:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by YJD落叶梧桐 at 2012-06-09 21:29:11
我的病毒全基因组有30-40kb左右,测序费用高,导师不同意,所以希望有更好的方法,其实他是想让我用单酶切和双酶切相结合的方法来验证,可是我还是不能分析出来...

测序费不是很高啊,30-40k的病毒,测序6000-8000就够了,用lllumina,而且如果是有价值的新病毒的话,现在测序还是挺好发文章的
5楼2012-06-10 12:03:17
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YJD落叶梧桐

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yyhheda at 2012-06-10 12:03:17
测序费不是很高啊,30-40k的病毒,测序6000-8000就够了,用lllumina,而且如果是有价值的新病毒的话,现在测序还是挺好发文章的...

lllumina是什么啊,我不太懂啊,谢谢指教
6楼2012-06-12 07:07:15
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YJD落叶梧桐

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chibang1220 at 2012-06-09 21:43:08
那工作量够大的啊,祝福楼主

说实话,我对这个分析方法不是很认同,你说的工作量是什么意思啊,我目前准备先,做两个酶之间的位置关系,让后再想办法来确认,不知你有什么好的建议,谢谢了
7楼2012-06-12 07:10:48
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yyhheda

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by YJD落叶梧桐 at 2012-06-12 07:07:15
lllumina是什么啊,我不太懂啊,谢谢指教...

illumina就是solexa,是第二代的高通量测序技术,一般的测序公司都可以做的,你可以找公司问问
8楼2012-06-13 11:37:00
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