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bizi294

金虫 (正式写手)

[求助] 如何计算molecular surface area

最近遇到一个问题,需要计算一个分子的升华焓,查询文献,发现有一种方法是通过静电势参数和分子表面积获得的。首先定义一个分子表面,即0.001 au包围的等值面,这个面上的静电势参数会计算,但是这个面的面积该如何计算啊?望高手们不吝赐教!包括用到的软件,处理方法等。
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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计算焓变必须用这种方法吗?
2楼2012-06-04 20:56:15
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

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bizi294: 金币+120, ★★★★★最佳答案, 多谢 2012-06-05 21:07:48
能计算分子表面积的软件多得很,比如VMD、chem3D、materialstudio等等。
Multiwfn也能计算分子表面积。如果你还需要计算和静电势有关的特殊的面积,比如静电势为正值/负值区域的面积,那么据我所知能公开下载的免费程序里也只有Multiwfn能算。可以参考手册4.12节的例子。
3楼2012-06-05 06:17:44
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ltscu

铜虫 (正式写手)

MSMS 用探针方法计算
4楼2012-06-05 21:34:10
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