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如何计算molecular surface area
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| 最近遇到一个问题,需要计算一个分子的升华焓,查询文献,发现有一种方法是通过静电势参数和分子表面积获得的。首先定义一个分子表面,即0.001 au包围的等值面,这个面上的静电势参数会计算,但是这个面的面积该如何计算啊?望高手们不吝赐教!包括用到的软件,处理方法等。 |
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2楼2012-06-04 20:56:15
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
bizi294: 金币+120, ★★★★★最佳答案, 多谢 2012-06-05 21:07:48
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能计算分子表面积的软件多得很,比如VMD、chem3D、materialstudio等等。 Multiwfn也能计算分子表面积。如果你还需要计算和静电势有关的特殊的面积,比如静电势为正值/负值区域的面积,那么据我所知能公开下载的免费程序里也只有Multiwfn能算。可以参考手册4.12节的例子。 |
3楼2012-06-05 06:17:44
4楼2012-06-05 21:34:10











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