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mengsk

金虫 (著名写手)

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专业: 催化化学

[求助] MS分析二面角分布

用MS/Discover模块跑完动力学，想要分析二面角的数据，遇到了问题。把我的操作过程写下，请各位高手看看哪里有问题，请多多指教！
1. 按正常步骤跑完MD，总时间100 ps，没10 fs输出一次构型；
2. 选择所需分析的二面角，选择菜单栏里的 Edit/Edit Sets，点击 New 添加该角度，并命名为D1;
3. 选择菜单栏里的 Modules/Discover/Analysis 打开 Discover Analysis对话框，选择 Dihedral distribution，点击 Define/Add to list，然后选择 Choose sets 的下拉菜单，这时应该出现已经定义过的 D1了吧？但我这里什么都没有。

请懂行的指点一下，谢谢！

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1楼 2012-06-02 10:47:51

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青菜001

金虫 (小有名气)

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专业: 金属材料表面科学与工程

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引用回帖:

7楼: Originally posted by mengsk at 2012-06-12 09:43:26
你可以新建一个 .xsd文件，手动画一个二面角，假如你想做一个 HCCH的二面角，那就画一个HCCH，保持该文件激活状态。然后选Edit/Find Patterns，在Pattern document下拉菜单里选中该二面角的文件，Match property选 ...

非常感谢，谢谢楼主的帮忙。