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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] MS分析二面角分布

用MS/Discover模块跑完动力学,想要分析二面角的数据,遇到了问题。把我的操作过程写下,请各位高手看看哪里有问题,请多多指教!
1. 按正常步骤跑完MD,总时间100 ps,没10 fs输出一次构型;
2. 选择所需分析的二面角,选择菜单栏里的 Edit/Edit Sets,点击 New 添加该角度,并命名为D1;
3. 选择菜单栏里的 Modules/Discover/Analysis 打开 Discover Analysis对话框,选择 Dihedral distribution,点击 Define/Add to list,然后选择 Choose sets 的下拉菜单,这时应该出现已经定义过的 D1了吧?但我这里什么都没有。

请懂行的指点一下,谢谢!
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奋斗中的小木虫
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青菜001

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by mengsk at 2012-06-12 09:43:26
你可以新建一个 .xsd文件,手动画一个二面角,假如你想做一个 HCCH的二面角,那就画一个HCCH,保持该文件激活状态。然后选Edit/Find Patterns,在Pattern document下拉菜单里选中该二面角的文件,Match property选 ...

非常感谢,谢谢楼主的帮忙。
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
8楼2012-06-12 10:19:24
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查看全部 12 个回答

mengsk

金虫 (著名写手)

没人回复啊,在线等...
奋斗中的小木虫
2楼2012-06-05 09:22:40
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visualization

金虫 (小有名气)


zh1987hs: 金币+1, 鼓励交流 2012-06-06 18:16:38
是不是应该把所有这一类型的二面角都选中,而不是只选择这一个。。可不可以拿来轨迹看看
3楼2012-06-05 11:32:31
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mimizong

新虫 (小有名气)

选一个如何看分布?纵横坐标分别是什么呢
4楼2012-06-06 16:06:30
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