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蓝妹妹

金虫 (小有名气)

[求助] 同一基因不同mRNA,如何设计定量引物?

X基因在转录时由于不同的启动区产生了两种不同的转录产物,Xa和Xb,两者只是第一外显子不同,我想做定量PCR来研究Xa和Xb的表达情况。
目前X基因在我做的这个物种中没有发表的基因序列,我该如何设计引物?
谢谢!
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

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yqbter: 金币+1, 鼓励发帖! 2012-06-02 10:25:16
我认为这种情况,应该先要克隆得到第一外显子的序列,然后再根据此段序列设计定量的引物。
2楼2012-06-02 00:34:31
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个物种中,是否也是这两种转录本都存在?
假设都存在,你可以试试同源克隆,拿到序列才好设计定量引物,不需要拿全长,就拿第一个exon就可以了
3楼2012-06-02 14:58:29
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