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Siriusgoul铜虫 (初入文坛)
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关于节点上运行的报错求解
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用G09优化一个带-1电荷的小发色团,报错如下: Error: segmentation violation rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff rdx 0000000000002701, rsp 00007fffffffad98, rbp 00007fffffffb370 rsi 000000000000000b, rdi 0000000000002701, r8 00002aaaaaae4b90 r9 0000000000000000, r10 0000000000000000, r11 0000000000000202 r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fffffffb3b8 r15 0000000000000000 --- traceback not available 输入文件的部分设置如下: Keywords: #opt ucam-b3lyp/6-311+g(d,p)/fit geom=connectivity Charge/Mult: -1 2 脚本如下: #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -q normal #PBS -j oe cd $PBS_O_WORKDIR # Source the Gaussian 09 Env export g09root=/apps/chem/Gaussian/G09_B01 . $g09root/g09/bsd/g09.profile mkdir -p /data/tmp/$USER/$PBS_JOBID export GAUSS_SCRDIR=/data/tmp/$USER/$PBS_JOBID NODES=`cat $PBS_NODEFILE | uniq` echo "--------------------------------------------------------" echo " JOBID: $PBS_JOBID" echo " The job was started at `date`" echo " The job was running at $NODES." # Run G09 Job g09 test.com echo " The job was finished at `date`" echo "--------------------------------------------------------" # Delete the tmp File rm -rf /data/tmp/$USER/$PBS_JOBID 求各路好手看看有没有什么不妥的地方,谢谢…… |
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