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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

[求助] 感到疑惑的HF能量的问题

得到反应路径的各个中间体，过渡态HF能量后发现一个问题，不明白出现什么错误了，请大家指教。一条路径React：HF=-2433.3574905，ts1：HF：2632.622447，int1：HF=-2433.3490413，int2：HF=-2433.3631576，ts3：HF=-2632.6331339，int3：HF=-2433.393256，ts4：HF=-2632.6422469，int4：HF=-2433.3807432
我找了四条路径有两条路经出现这种现象，另外两条HF能量前四位一样，而其余两条路径前四位出现差异一样，都是前四位不同，能量差异太大，但是算完溶剂化效应后HF能量前四位是一致的，不好的地方是中间体的能量比过渡态的高，-2633.5441533，-2633.5328648，-2633.5254812，-2633.
5396923，-2633.537805，-2633.5723864，-2633.
5447727，
请问这是为什么出现这种情况？
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
1楼 2012-05-30 16:00:28
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kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-05-31 14:20:25
游子8921: 金币+60, ★★★★★最佳答案, 谢啦 2012-05-31 21:59:17
引用回帖:
2楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-05-31 09:04:16
为何没有高手解答呢？问题肤浅吗？还是棘手，没说明白/

前面优化得到的HF能量我怀疑是有的过渡态中包含了中间体中没有的物种，这样前后能量会差异很大，但是你说溶剂化能加上就正常了，我就不清楚是怎么回事了，除非你把输出文件贴上来看看。另外加溶剂化能之后过渡态比中间体能量低也是常见的，这是因为优化是考虑的电子能量，而没有考虑溶剂化能和热力学校正。所以不同能量标度下出现这种情况也正常。你可以多注意找找近期理论计算的文献，细心一点就会发现这种情况。
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3楼2012-05-31 11:00:46
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
为何没有高手解答呢？问题肤浅吗？还是棘手，没说明白/
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
2楼2012-05-31 09:04:16
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
3楼: Originally posted by kaegi at 2012-05-31 11:00:46
前面优化得到的HF能量我怀疑是有的过渡态中包含了中间体中没有的物种，这样前后能量会差异很大，但是你说溶剂化能加上就正常了，我就不清楚是怎么回事了，除非你把输出文件贴上来看看。另外加溶剂化能之后过渡态比 ...

中间体和过渡态结构没有额外的添加进原子，原子数一样的。我想上传log文件，但不知道怎么上传，没有上传的选项
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
4楼2012-05-31 15:08:43
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