24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 884  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

929272582

铁虫 (初入文坛)

[求助] zn离子在amber中处理显示为四面体结构

zn离子在amber中处理后,还未加水之前,保存成.prmtop 和.inpcrd文件,再在vmd中打开.prmtop 和.inpcrd文件后,zn离子显示为四面体结构,很奇怪的结构,这是怎么回事?希望得到高手指点,谢谢

图中两个绿色多面体结构为zn离子



[ Last edited by 929272582 on 2012-5-29 at 14:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

929272582

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-05-30 09:58:47
这个是正确的显示,zn离子可以和有机化合物或周围的氨基酸残基形成4配位结构。

谢谢
3楼2012-05-30 10:37:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
929272582: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-30 10:35:14
这个是正确的显示,zn离子可以和有机化合物或周围的氨基酸残基形成4配位结构。
2楼2012-05-30 09:58:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuwei4410

金虫 (正式写手)

我想请教一下楼主,是怎么让amber可以识别zn离子的?谢谢了啊!
一切都是浮云,开心最重要!
4楼2012-05-30 18:54:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

929272582

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liuwei4410 at 2012-05-30 18:54:24
我想请教一下楼主,是怎么让amber可以识别zn离子的?谢谢了啊!

amber官网有哦,你可以看看
5楼2012-06-03 08:56:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
[考研] 本科双非材料,跨考一志愿华电085801电气,283求调剂,任何专业都可以 +5 芝士雪baoo 2026-03-28 6/300 2026-03-28 15:25 by 1018329917
[考研] 0703化学 +10 妮妮ninicgb 2026-03-27 10/500 2026-03-28 14:07 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 299求调剂 +7 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 7/350 2026-03-28 13:09 by 唐沐儿
[考研] 材料277求调剂 +7 min3 2026-03-24 7/350 2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +4 手机用户 2026-03-26 4/200 2026-03-28 07:17 by mmm just
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考博] 26申博 +3 加油冲啊! 2026-03-26 3/150 2026-03-27 15:38 by cls512
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-26 9/450 2026-03-27 11:10 by 不吃魚的貓
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 5/250 2026-03-27 10:33 by wangjy2002
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +10 材料学257求调剂 2026-03-23 11/550 2026-03-27 10:13 by YCIT- LHL
[考研] 342求调剂 +3 加油a李zs 2026-03-26 3/150 2026-03-27 00:29 by wxiongid
[考研] 349求调剂 +4 李木子啊哈哈 2026-03-25 4/200 2026-03-26 22:49 by fmesaito
[考研] 一志愿北化求调剂 +3 Jsman 2026-03-22 3/150 2026-03-26 21:06 by ajpv风雷
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-26 4/200 2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[考博] 26申博自荐 +3 whh869393 2026-03-24 3/150 2026-03-24 09:55 by 21018060
信息提示
请填处理意见