应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » zn离子在amber中处理显示为四面体结构
61/1返回列表
查看: 847  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

929272582

铁虫 (初入文坛)

[求助] zn离子在amber中处理显示为四面体结构

zn离子在amber中处理后，还未加水之前，保存成.prmtop 和.inpcrd文件，再在vmd中打开.prmtop 和.inpcrd文件后，zn离子显示为四面体结构，很奇怪的结构，这是怎么回事？希望得到高手指点，谢谢

图中两个绿色多面体结构为zn离子



[ Last edited by 929272582 on 2012-5-29 at 14:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-05-29 14:16:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
929272582: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-30 10:35:14
这个是正确的显示，zn离子可以和有机化合物或周围的氨基酸残基形成4配位结构。
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-30 09:58:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

929272582

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-05-30 09:58:47
这个是正确的显示，zn离子可以和有机化合物或周围的氨基酸残基形成4配位结构。

谢谢
回复此楼
3楼2012-05-30 10:37:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuwei4410

金虫 (正式写手)
我想请教一下楼主，是怎么让amber可以识别zn离子的？谢谢了啊！
赞一下 回复此楼
一切都是浮云，开心最重要！
4楼2012-05-30 18:54:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

929272582

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuwei4410 at 2012-05-30 18:54:24
我想请教一下楼主，是怎么让amber可以识别zn离子的？谢谢了啊！

amber官网有哦，你可以看看
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-03 08:56:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jennie宁

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 929272582 at 2012-06-03 08:56:55
amber官网有哦，你可以看看...

不好意思，我想请问一下，楼主，官网哪里有哎，关于amber中分子和金属作用的，没有找到哎，是在例子里面吗
赞一下 回复此楼
6楼2013-07-15 17:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 929272582 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭