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emma立夏

铁虫 (初入文坛)

[求助] 如何提高连接效率呢?

各位科研上的战友,大家帮我看看分析一下实验失败的原因。
我是从T载体上双酶切(酶为EcoR I和Sal I)下了我的目的片段,然后载体也已经用相同的酶的线性化,做到连接转化这一步老是不成功,很困惑。
连接体系是:
片段        6ul
线性化载体  2ul
T4ligase         1ul
buffer            1ul
total            10ul

16℃反应4h,4℃过夜,之后加100ul感受态。转化

在转化和感受态都是没问题的,因为做了对照试验。
我的浓度比基本都是看条带marker亮度估算的,没用相关仪器来检测准确浓度。
很多战友都说要不断摸索片段和载体的浓度比【这步是否需要呢?】。那这样是否需要很多次的连接转化呢?
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chenyhok1987

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-05-30 13:42:10
载体与目的基因摩尔比是1:3到1:10之间,你每次根绝Marker估计一下DNA的质量,然后计算一下DNA的分子量,这么一比就是摩尔数的,这个比例在重组连接中是很关键的,我做的是一端平端一段粘端都是这样连接起来的,我一般采用大致1:10的比例。
平生多磨砺,男儿自横行!
13楼2012-05-30 10:24:46
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yunocn

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
比例很重要,一次连接可尝试3种比例
2楼2012-05-28 17:17:27
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caohaojie316

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以一次尝试很多比例
岂能皆尽人意,但求无愧我心!
3楼2012-05-28 21:47:49
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countingcrow

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流,这的确是需要注意的哦 2012-05-29 13:48:11
有几个问题:
1.  载体上ECOR I 和 Sal I 位点距离会不会太近?一般来说两个克隆位点如果相距太近,会影响酶切效率,导致只有一个位点切开。
2. 载体酶切时条件掌握得好不好,酶切时间会不会太短?如果酶切条件不好,会使载体酶切不完全。
3. 感受态细胞的体积是不是考虑搞多一些,否则酶切体系里的甘油会影响转化效率。
4. 载体的抗性基因是不是搞错了,是卡那抗性还是氨苄抗性。
4楼2012-05-29 06:33:32
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