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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 化合物只有%抑制率，想做comfa,如下转换可行吗？
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 化合物只有%抑制率，想做comfa,如下转换可行吗？

这批化合物的抑制率从15-80%不等，如果做Comfa分析的话，需要转换成-LOg值比较好。
比如一个化合物的抑制率为20%，我用-log0.2=0.69是个小数，所有数据基本都是介于0-1之间。可否将这些小数都乘以10，得到的活性都比较好，comfa模型也比较好。但这样的转换是否合理？
如果不合理，请问大虾们是怎么转换的呢？
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1楼2012-05-25 09:20:17
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Tavel

铜虫 (小有名气)
★ ★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-28 00:38:54
SYBYL软件里好像有一个数据转换的地方，依稀记得是在QSAR Project里面，因为CoMFA是统计学模型，你所有数据同时乘以10，数据依然保持了一个较好的活性梯度，故依然能有一个好的模拟结果
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5楼2012-05-27 23:45:49
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-27 13:09:15
单一数据没意义，最好还是用IC50
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-27 07:39:07
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