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化合物只有%抑制率,想做comfa,如下转换可行吗?
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wohaihao
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化合物只有%抑制率,想做comfa,如下转换可行吗?
这批化合物的抑制率从15-80%不等,如果做Comfa分析的话,需要转换成-LOg值比较好。
比如一个化合物的抑制率为20%,我用-log0.2=0.69是个小数,所有数据基本都是介于0-1之间。可否将这些小数都乘以10,得到的活性都比较好,comfa模型也比较好。但这样的转换是否合理?
如果不合理,请问大虾们是怎么转换的呢?
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2012-05-25 09:20:17
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wohaihao
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2012-05-25 10:39:59
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★ ★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2012-05-27 13:09:15
单一数据没意义,最好还是用IC50
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2012-05-27 07:39:07
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★ ★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2012-05-28 00:38:54
SYBYL软件里好像有一个数据转换的地方,依稀记得是在QSAR Project里面,因为CoMFA是统计学模型,你所有数据同时乘以10,数据依然保持了一个较好的活性梯度,故依然能有一个好的模拟结果
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5楼
2012-05-27 23:45:49
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strive123123
2楼
2012-05-25 10:16
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wohaihao(金币+1): 谢谢参与
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