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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 由优化后的POSCAR建模问题
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人生果

新虫 (小有名气)

[求助] 由优化后的POSCAR建模问题

各位大侠好，请问下我用vasp优化后，用得到的POSCAR在MS里建模行吗？我在建模过程中有几次出现这样的提示：
Chosen position is within the specified tolerance(1.0) of existing atoms.
Do you wish to continue adding an atom at this position?
是不是有什么问题？
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1楼 2012-05-24 12:56:52
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-05-25 08:59:28
人生果: 金币+10, ★有帮助 2012-06-05 16:25:10
楼主如果是按照POSCAR里面优化的原子位置自己在MS中手动输入建模的话，很可能出现这种的问题。原因我个人认为，很可能是你没有区分哪些是等效原子位置，这样当楼主在输入一些等效原子位置时就等于重复输入，所以会提示你这个原子位置上已经有原子存在了。
    少量原子可以手动输入，对于原子数太多的话可以采用2楼的方法，很方便。
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3楼2012-05-24 22:00:44
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huangll99

木虫 (职业作家)
★
WDD880227: 金币+1, 多谢提示 2012-05-24 16:53:24
不知道你怎么建的，说说我的办法
把POSCAR转成CIF文件（用VESTA），直接用MS打开
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-24 15:28:19
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