24小时热门版块排行榜    

查看: 1864  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

[求助] Quntum espresso “relax” 计算出错

最近在用Quntum espresso优化一个二氧化钛的cluster,可是老是会出现同样的错误。哪位高手给我看看,谢谢了!下面是我的输入和输出文件:
输入文件:
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-opt',
  pseudo_dir   = '/home/yanglina/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/yanglina/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143,
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 25.D0,
  ecutrho   = 200.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES      
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
  O   0.3801050751713581   0.2723498562115601   1.5401106113869194
  O   0.3415217759647393   0.2847308199123059   1.4814234221664027
  O   0.3234942302591234   0.3324900497786905   1.5572849396990445
  ......
  ......
K_POINTS {Gamma}
输出文件:

   Initial potential from superposition of free atoms
     Check: negative starting charge=   -0.896111

     starting charge  873.99821, renormalised to  912.00000

     negative rho (up, down):  0.935E+00 0.000E+00
     Starting wfc are  684 atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is     1040.9 secs

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    25.00 Ry     beta=0.70
     Davidson diagonalization with overlap
rank 4 in job 1  c2_50670   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 4: return code 41
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

come on!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 043114076 at 2012-05-24 19:42:30:
能不能把完整的初始文件附上

输入文件:
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-opt',
  pseudo_dir   = '/home/yanglina/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/yanglina/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143,
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 25.D0,
  ecutrho   = 200.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES      
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
  O   0.3373429082725292   0.3011755527836822   0.5414774336280653
  O   0.3044106060877458   0.3036187361589792   0.4812127377178885
  O   0.2815672636826734   0.3659219992095049   0.5529294989826210
  O   0.2519655150252034   0.4245320810076478   0.5260910032458588
  O   0.3548469918793064   0.4083992663403931   0.5397017433896345
  O   0.3077411730377633   0.3597856324151362   0.5146389383957004
  O   0.3558065347119876   0.3498722197470593   0.4721709937017791
  O   0.3219146896945233   0.4108424497156903   0.4794370474794608
  O   0.2990713472894500   0.4731457127662217   0.5511538087441925
  O   0.2694696008261423   0.5317558080050109   0.5243153127848435
  O   0.3723510776802486   0.5156229933377644   0.5379260529286255
  O   0.2661400166430217   0.4755882513244821   0.4908791223697601
  O   0.3252452566445415   0.4670093459718541   0.5128632481572694
  O   0.3733106183187656   0.4570959333037791   0.4703953034633517
  O   0.3394187754954647   0.5180661767130567   0.4776613570184482
  O   0.3165754308962286   0.5803694263229283   0.5493781185057671
  O   0.2869736844329215   0.6389795215617197   0.5225396225464190
  O   0.3898551612870279   0.6228467068944690   0.5361503626901971
  O   0.2836441002497984   0.5828119648811833   0.4891034321313357
  O   0.3427493402513190   0.5742330595285596   0.5110875579188463
  O   0.3908147019255441   0.5643196468604861   0.4686196132249260
  O   0.3569228591022431   0.6252898902697678   0.4758856667800198
  O   0.3340795145030064   0.6875931398796403   0.5476024282673406
  O   0.3011481838565773   0.6900356784378952   0.4873277418929066
  O   0.3602534238580993   0.6814567730852708   0.5093118676804170
  O   0.4083187855323237   0.6715433604171934   0.4668439229864996
  O   0.4183366138434645   0.2888201657832897   0.5592857501503840
  O   0.5255042153467878   0.2703284141552123   0.5388035055813821
  O   0.3854052831970362   0.2912627043415464   0.4990110637759523
  O   0.4445105366212630   0.2826837968222349   0.5209951900678619
  O   0.4925758714500823   0.2727703884875315   0.4785272443651438
  O   0.4115811943407879   0.2851264203049623   0.4607289183070802
  O   0.3887348517632926   0.3474302497481118   0.5324472539092213
  O   0.5430082989535675   0.3775521277119225   0.5370278153429542
  O   0.4916163554628077   0.3312974307474936   0.5460579950617969
  O   0.5396787035419050   0.3213845866387263   0.5035916242008864
  O   0.4029093668038146   0.3984864178982576   0.4972353735375225
  O   0.5987839838115350   0.3128056747860453   0.5255757515015952
  O   0.4620146202280452   0.3899075103789461   0.5192194998294325
  O   0.5100799550568577   0.3799941020442424   0.4767515541267157
  O   0.4586840264326174   0.3337406184561574   0.4857932981428247
  O   0.6129574736228853   0.3638624964199688   0.4903738595765579
  O   0.5658546146856546   0.3152483026021434   0.4653094787320156
  O   0.4290852779475656   0.3923501338616733   0.4589532280686530
  O   0.4533447832511889   0.5032676063373733   0.5557343694509412
  O   0.4062389353700710   0.4546539633048272   0.5306715636707952
  O   0.5605123847545082   0.4847758547092951   0.5352521248819420
  O   0.5091204390695849   0.4385211443042054   0.5442823048233687
  O   0.5571827871486815   0.4286083001954365   0.5018159339624599
  O   0.4204134526047572   0.5057101448956223   0.4954596830765106
  O   0.6162880674183116   0.4200293883427559   0.5238000612631641
  O   0.4795187060289874   0.4971312373763192   0.5174438093684177
  O   0.5275840408577960   0.4872178290416123   0.4749758636657032
  O   0.4761881100393987   0.4409643320128708   0.4840176079043961
  O   0.6304615594238278   0.4710862234173398   0.4885981691155447
  O   0.5833586982924327   0.4224720161588544   0.4635337884935873
  O   0.4708488668579672   0.6104913198940781   0.5539586792125189
  O   0.4237430189768496   0.5618776768615349   0.5288958734323659
  O   0.5780164683612854   0.5919995682659973   0.5334764346435128
  O   0.5266245226763573   0.5457448578609143   0.5425066145849447
  O   0.5746868707554584   0.5358320137521501   0.5000402437240317
  O   0.4379175362115340   0.6129338584523343   0.4936839928380839
  O   0.6337921510250882   0.5272531018994656   0.5220243710247394
  O   0.4970227896357608   0.6043549509330246   0.5156681191299942
  O   0.5450881244645740   0.5944415425983164   0.4732001734272759
  O   0.4936921936461766   0.5481880455695820   0.4822419176659712
  O   0.6479656430306050   0.5783099369740450   0.4868224788771171
  O   0.4640934473552883   0.6067975744157520   0.4554018473692124
  O   0.4412471025836285   0.6691013904182460   0.5271201831939446
  O   0.5441286062831354   0.6529685714176230   0.5407309243465149
  O   0.5921909543622344   0.6430557273088559   0.4982645534856026
  O   0.6512962346318658   0.6344768154561767   0.5202486807863138
  O   0.5111962772529487   0.6554117591262896   0.4804662274275408
  O   0.6183668655059866   0.6369194432722741   0.4599824080167349
  O   0.2495828013969948   0.3747196524667989   0.4910328560833822
  O   0.5963522267668011   0.5342591270798052   0.4576194329236457
Ti   0.2541568730942218   0.3690318328043796   0.5248850554079290
Ti   0.3351515502035113   0.3566758009869476   0.5426833814659948
Ti   0.2716609567009996   0.4762555463610974   0.5231093651695000
Ti   0.3526556338102876   0.4638995145436637   0.5409076912275663
Ti   0.3197263183752245   0.4663421336930226   0.4806414204755811
Ti   0.2891650403077756   0.5834792599178018   0.5213336749310773
Ti   0.3701597174170679   0.5711232281003702   0.5391320009891372
Ti   0.3372304019820022   0.5735658472497274   0.4788657302371554
Ti   0.3066691239145541   0.6907029734745108   0.5195579846926468
Ti   0.3876638010238456   0.6783469416570792   0.5373563107507100
Ti   0.3547344855887797   0.6807895608064369   0.4770900399987278
Ti   0.3909262098323112   0.2919300015448481   0.5312413060712924
Ti   0.4719209137870121   0.2795739653940461   0.5490396331381534
Ti   0.3579978896115343   0.2943719736045921   0.4709650775764097
Ti   0.4389915715065355   0.2820165888767740   0.4887733613773729
Ti   0.5451996570225858   0.3220518795086589   0.5358218675050254
Ti   0.4894249973937923   0.3867976789507587   0.5472639428997282
Ti   0.5122713099564018   0.3244938559017723   0.4755456380013448
Ti   0.3755019732183118   0.4015956871613042   0.4691893873379808
Ti   0.5932649918514004   0.3121384711739539   0.4933539218023094
Ti   0.4564956551133164   0.3892403024334844   0.4869976711389458
Ti   0.5627037406293611   0.4292755930653685   0.5340461772665971
Ti   0.4259343792400310   0.5063774420989293   0.5276899253718513
Ti   0.5069290831947294   0.4940214059481310   0.5454882524387098
Ti   0.5297753935631789   0.4317175694584842   0.4737699477629179
Ti   0.3930060590192543   0.5088194141586685   0.4674136968769688
Ti   0.6107690754581781   0.4193621847306645   0.4915782315638805
Ti   0.5802078242361368   0.5364993066220815   0.5322704870281738
Ti   0.4434384628468106   0.6136011556556360   0.5259142351334277
Ti   0.5244331668015035   0.6012451195048350   0.5437125622002885
Ti   0.4105101426260316   0.6160431277153791   0.4656380066385412
Ti   0.6282731590649567   0.5265858982873767   0.4898025413254535
Ti   0.4915038245210379   0.6036877429875620   0.4834462904395065
Ti   0.5977119078429162   0.6437230201787882   0.5304947967897429
Ti   0.5647835607767323   0.6461649965719035   0.4702185672860617
Ti   0.6457772426717354   0.6338096118440839   0.4880268510870277
Ti   0.3054779338250356   0.3627274894455362   0.4792453114817094
Ti   0.5438037095711999   0.5428012979023625   0.4687750978895950
K_POINTS {Gamma}
come on!
7楼2012-05-24 22:37:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-05-24 01:19:11
你用xcrysden 看一下结构有没有不合理的
2楼2012-05-23 21:53:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-05-23 21:53:49:
你用xcrysden 看一下结构有没有不合理的

这个.out文件打不开啊!
come on!
3楼2012-05-23 22:10:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


uuv2010: 金币+1, 多谢指导 2012-05-24 09:19:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanglina062 at 2012-05-23 22:10:21:
这个.out文件打不开啊!

用xcrysden打开输入文件
4楼2012-05-24 09:04:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 5/250 2026-08-31 14:40 by hahaboy
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 11:51 by xiangy672
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见