24小时热门版块排行榜    

查看: 1862  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

[求助] Quntum espresso “relax” 计算出错

最近在用Quntum espresso优化一个二氧化钛的cluster,可是老是会出现同样的错误。哪位高手给我看看,谢谢了!下面是我的输入和输出文件:
输入文件:
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-opt',
  pseudo_dir   = '/home/yanglina/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/yanglina/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143,
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 25.D0,
  ecutrho   = 200.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES      
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
  O   0.3801050751713581   0.2723498562115601   1.5401106113869194
  O   0.3415217759647393   0.2847308199123059   1.4814234221664027
  O   0.3234942302591234   0.3324900497786905   1.5572849396990445
  ......
  ......
K_POINTS {Gamma}
输出文件:

   Initial potential from superposition of free atoms
     Check: negative starting charge=   -0.896111

     starting charge  873.99821, renormalised to  912.00000

     negative rho (up, down):  0.935E+00 0.000E+00
     Starting wfc are  684 atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is     1040.9 secs

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    25.00 Ry     beta=0.70
     Davidson diagonalization with overlap
rank 4 in job 1  c2_50670   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 4: return code 41
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

come on!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 043114076 at 2012-05-24 19:42:30:
能不能把完整的初始文件附上

输入文件:
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-opt',
  pseudo_dir   = '/home/yanglina/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/yanglina/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143,
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 25.D0,
  ecutrho   = 200.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES      
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
  O   0.3373429082725292   0.3011755527836822   0.5414774336280653
  O   0.3044106060877458   0.3036187361589792   0.4812127377178885
  O   0.2815672636826734   0.3659219992095049   0.5529294989826210
  O   0.2519655150252034   0.4245320810076478   0.5260910032458588
  O   0.3548469918793064   0.4083992663403931   0.5397017433896345
  O   0.3077411730377633   0.3597856324151362   0.5146389383957004
  O   0.3558065347119876   0.3498722197470593   0.4721709937017791
  O   0.3219146896945233   0.4108424497156903   0.4794370474794608
  O   0.2990713472894500   0.4731457127662217   0.5511538087441925
  O   0.2694696008261423   0.5317558080050109   0.5243153127848435
  O   0.3723510776802486   0.5156229933377644   0.5379260529286255
  O   0.2661400166430217   0.4755882513244821   0.4908791223697601
  O   0.3252452566445415   0.4670093459718541   0.5128632481572694
  O   0.3733106183187656   0.4570959333037791   0.4703953034633517
  O   0.3394187754954647   0.5180661767130567   0.4776613570184482
  O   0.3165754308962286   0.5803694263229283   0.5493781185057671
  O   0.2869736844329215   0.6389795215617197   0.5225396225464190
  O   0.3898551612870279   0.6228467068944690   0.5361503626901971
  O   0.2836441002497984   0.5828119648811833   0.4891034321313357
  O   0.3427493402513190   0.5742330595285596   0.5110875579188463
  O   0.3908147019255441   0.5643196468604861   0.4686196132249260
  O   0.3569228591022431   0.6252898902697678   0.4758856667800198
  O   0.3340795145030064   0.6875931398796403   0.5476024282673406
  O   0.3011481838565773   0.6900356784378952   0.4873277418929066
  O   0.3602534238580993   0.6814567730852708   0.5093118676804170
  O   0.4083187855323237   0.6715433604171934   0.4668439229864996
  O   0.4183366138434645   0.2888201657832897   0.5592857501503840
  O   0.5255042153467878   0.2703284141552123   0.5388035055813821
  O   0.3854052831970362   0.2912627043415464   0.4990110637759523
  O   0.4445105366212630   0.2826837968222349   0.5209951900678619
  O   0.4925758714500823   0.2727703884875315   0.4785272443651438
  O   0.4115811943407879   0.2851264203049623   0.4607289183070802
  O   0.3887348517632926   0.3474302497481118   0.5324472539092213
  O   0.5430082989535675   0.3775521277119225   0.5370278153429542
  O   0.4916163554628077   0.3312974307474936   0.5460579950617969
  O   0.5396787035419050   0.3213845866387263   0.5035916242008864
  O   0.4029093668038146   0.3984864178982576   0.4972353735375225
  O   0.5987839838115350   0.3128056747860453   0.5255757515015952
  O   0.4620146202280452   0.3899075103789461   0.5192194998294325
  O   0.5100799550568577   0.3799941020442424   0.4767515541267157
  O   0.4586840264326174   0.3337406184561574   0.4857932981428247
  O   0.6129574736228853   0.3638624964199688   0.4903738595765579
  O   0.5658546146856546   0.3152483026021434   0.4653094787320156
  O   0.4290852779475656   0.3923501338616733   0.4589532280686530
  O   0.4533447832511889   0.5032676063373733   0.5557343694509412
  O   0.4062389353700710   0.4546539633048272   0.5306715636707952
  O   0.5605123847545082   0.4847758547092951   0.5352521248819420
  O   0.5091204390695849   0.4385211443042054   0.5442823048233687
  O   0.5571827871486815   0.4286083001954365   0.5018159339624599
  O   0.4204134526047572   0.5057101448956223   0.4954596830765106
  O   0.6162880674183116   0.4200293883427559   0.5238000612631641
  O   0.4795187060289874   0.4971312373763192   0.5174438093684177
  O   0.5275840408577960   0.4872178290416123   0.4749758636657032
  O   0.4761881100393987   0.4409643320128708   0.4840176079043961
  O   0.6304615594238278   0.4710862234173398   0.4885981691155447
  O   0.5833586982924327   0.4224720161588544   0.4635337884935873
  O   0.4708488668579672   0.6104913198940781   0.5539586792125189
  O   0.4237430189768496   0.5618776768615349   0.5288958734323659
  O   0.5780164683612854   0.5919995682659973   0.5334764346435128
  O   0.5266245226763573   0.5457448578609143   0.5425066145849447
  O   0.5746868707554584   0.5358320137521501   0.5000402437240317
  O   0.4379175362115340   0.6129338584523343   0.4936839928380839
  O   0.6337921510250882   0.5272531018994656   0.5220243710247394
  O   0.4970227896357608   0.6043549509330246   0.5156681191299942
  O   0.5450881244645740   0.5944415425983164   0.4732001734272759
  O   0.4936921936461766   0.5481880455695820   0.4822419176659712
  O   0.6479656430306050   0.5783099369740450   0.4868224788771171
  O   0.4640934473552883   0.6067975744157520   0.4554018473692124
  O   0.4412471025836285   0.6691013904182460   0.5271201831939446
  O   0.5441286062831354   0.6529685714176230   0.5407309243465149
  O   0.5921909543622344   0.6430557273088559   0.4982645534856026
  O   0.6512962346318658   0.6344768154561767   0.5202486807863138
  O   0.5111962772529487   0.6554117591262896   0.4804662274275408
  O   0.6183668655059866   0.6369194432722741   0.4599824080167349
  O   0.2495828013969948   0.3747196524667989   0.4910328560833822
  O   0.5963522267668011   0.5342591270798052   0.4576194329236457
Ti   0.2541568730942218   0.3690318328043796   0.5248850554079290
Ti   0.3351515502035113   0.3566758009869476   0.5426833814659948
Ti   0.2716609567009996   0.4762555463610974   0.5231093651695000
Ti   0.3526556338102876   0.4638995145436637   0.5409076912275663
Ti   0.3197263183752245   0.4663421336930226   0.4806414204755811
Ti   0.2891650403077756   0.5834792599178018   0.5213336749310773
Ti   0.3701597174170679   0.5711232281003702   0.5391320009891372
Ti   0.3372304019820022   0.5735658472497274   0.4788657302371554
Ti   0.3066691239145541   0.6907029734745108   0.5195579846926468
Ti   0.3876638010238456   0.6783469416570792   0.5373563107507100
Ti   0.3547344855887797   0.6807895608064369   0.4770900399987278
Ti   0.3909262098323112   0.2919300015448481   0.5312413060712924
Ti   0.4719209137870121   0.2795739653940461   0.5490396331381534
Ti   0.3579978896115343   0.2943719736045921   0.4709650775764097
Ti   0.4389915715065355   0.2820165888767740   0.4887733613773729
Ti   0.5451996570225858   0.3220518795086589   0.5358218675050254
Ti   0.4894249973937923   0.3867976789507587   0.5472639428997282
Ti   0.5122713099564018   0.3244938559017723   0.4755456380013448
Ti   0.3755019732183118   0.4015956871613042   0.4691893873379808
Ti   0.5932649918514004   0.3121384711739539   0.4933539218023094
Ti   0.4564956551133164   0.3892403024334844   0.4869976711389458
Ti   0.5627037406293611   0.4292755930653685   0.5340461772665971
Ti   0.4259343792400310   0.5063774420989293   0.5276899253718513
Ti   0.5069290831947294   0.4940214059481310   0.5454882524387098
Ti   0.5297753935631789   0.4317175694584842   0.4737699477629179
Ti   0.3930060590192543   0.5088194141586685   0.4674136968769688
Ti   0.6107690754581781   0.4193621847306645   0.4915782315638805
Ti   0.5802078242361368   0.5364993066220815   0.5322704870281738
Ti   0.4434384628468106   0.6136011556556360   0.5259142351334277
Ti   0.5244331668015035   0.6012451195048350   0.5437125622002885
Ti   0.4105101426260316   0.6160431277153791   0.4656380066385412
Ti   0.6282731590649567   0.5265858982873767   0.4898025413254535
Ti   0.4915038245210379   0.6036877429875620   0.4834462904395065
Ti   0.5977119078429162   0.6437230201787882   0.5304947967897429
Ti   0.5647835607767323   0.6461649965719035   0.4702185672860617
Ti   0.6457772426717354   0.6338096118440839   0.4880268510870277
Ti   0.3054779338250356   0.3627274894455362   0.4792453114817094
Ti   0.5438037095711999   0.5428012979023625   0.4687750978895950
K_POINTS {Gamma}
come on!
7楼2012-05-24 22:37:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-05-24 01:19:11
你用xcrysden 看一下结构有没有不合理的
2楼2012-05-23 21:53:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-05-23 21:53:49:
你用xcrysden 看一下结构有没有不合理的

这个.out文件打不开啊!
come on!
3楼2012-05-23 22:10:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


uuv2010: 金币+1, 多谢指导 2012-05-24 09:19:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanglina062 at 2012-05-23 22:10:21:
这个.out文件打不开啊!

用xcrysden打开输入文件
4楼2012-05-24 09:04:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见