24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2450  |  回复: 16
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mche2005

木虫 (正式写手)

7-5-3

[求助] 在用CTAB法提取曲霉总DNA时,提取很多次没有成功,期望大家多多帮助。

1、PDA培养适当时间(72h),真菌菌丝体9000转离心3min,滤纸吸水。吸除绝大部分水分,否则,含水量过大会严重影响液氮研磨的效率。
或者直接用灭菌的八折纱布进行过滤。
2、研钵(液氮研磨)至粉末。快速研磨,严防液氮溅射。研磨过程中防止样品因为液氮挥发所导致的冻融。
3、加入预热的CTAB700uL,轻柔的颠倒混匀,65℃水浴1h(每隔10min摇一次),室温12000rpm,10min,吸取上清。
4、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,取上清(500uL)。
5、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,4℃离心后,取上清液(500uL)。
6、加入-20℃预先冷存异丙醇(2/3体积),-20℃冰箱沉淀1h。12000rpm,10min,4℃离心后取上清。
7、75%乙醇洗涤2次,12000rpm,3min,4℃离心。
8、室温晾干10-15min,加入20-50uL TE溶解。
9、加入RNase A (10 mg/mL) ,37℃保温30 min 以上。
10、取 4u L 电泳。加入1uL Rnase 37摄氏度消化30min,电泳检测结果


结果,提了很多次都没有成功,请问是什么原因?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wsw2t

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mche2005: 金币+2, ★★★很有帮助, 你有没有试过如果不加CTAB沉淀剂的情况下,能不能提出来总DNA? 2012-05-25 10:14:48
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 热心回帖,一起奖励EPI一枚~ 2012-05-26 10:52:51
给你一个我当时提DNA的详细步骤吧,有问题欢迎继续交流吧!
取50 mg  菌丝,加入液氮研磨成粉末状,加入600 µL CTAB  抽提液(2% CTAB,100 mmol Tris-HCl (pH 8.0),20 mmol EDTA,1.4 mol NaCl,pH 8.0,2% β-巯基乙醇)中,65℃温浴1 h。在抽提液中加入650 µL  氯仿-异戊醇(24﹕1),混匀后离心取上清,同法再抽提1遍。在上清中加入1 mL CTAB 沉淀液[1% CTAB,50 mmol Tris-HCl(pH 8.0),10 mmol EDTA],室温沉淀30 min,12 000 r/min 离心4 min,倒上清,将沉淀溶于 400 µL  高盐 TE[10 mmol Tris-HCl(pH 8.0),0.1 mmol EDTA,1 mol NaCl],37℃30 min  溶解。加入两倍体积-20℃无水乙醇在20℃沉淀2 h,12 000 r/min 离心5 min,风干后加入80 µL TE。取4 µL DNA  在1.5%  琼脂糖凝胶上电泳,剩余DNA-20℃保存备用.
14楼2012-05-25 09:10:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-23 14:06:33
离心怎么是常温呢?4度离心的。异丙醇沉淀时候我们是等体积。ctab是2%的吧,试一下3%的,再加一些pvp 1%和 巯基乙醇 1%,我就是这样提真菌的dna 很好用。第二次抽提 用氯仿。
2楼2012-05-23 11:32:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mche2005: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢您的帮助 2012-05-23 12:25:23
液氮研磨时研磨得充分一些,CTAB裂解时间再加长一些试试。
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
3楼2012-05-23 11:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

植物园园长

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用试剂盒不更好,方便又好用,
在路上~~Marketing!
4楼2012-05-23 16:37:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见