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mche2005木虫 (正式写手)
7-5-3
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[求助]
在用CTAB法提取曲霉总DNA时,提取很多次没有成功,期望大家多多帮助。
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1、PDA培养适当时间(72h),真菌菌丝体9000转离心3min,滤纸吸水。吸除绝大部分水分,否则,含水量过大会严重影响液氮研磨的效率。 或者直接用灭菌的八折纱布进行过滤。 2、研钵(液氮研磨)至粉末。快速研磨,严防液氮溅射。研磨过程中防止样品因为液氮挥发所导致的冻融。 3、加入预热的CTAB700uL,轻柔的颠倒混匀,65℃水浴1h(每隔10min摇一次),室温12000rpm,10min,吸取上清。 4、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,取上清(500uL)。 5、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,4℃离心后,取上清液(500uL)。 6、加入-20℃预先冷存异丙醇(2/3体积),-20℃冰箱沉淀1h。12000rpm,10min,4℃离心后取上清。 7、75%乙醇洗涤2次,12000rpm,3min,4℃离心。 8、室温晾干10-15min,加入20-50uL TE溶解。 9、加入RNase A (10 mg/mL) ,37℃保温30 min 以上。 10、取 4u L 电泳。加入1uL Rnase 37摄氏度消化30min,电泳检测结果 结果,提了很多次都没有成功,请问是什么原因? |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mche2005: 金币+2, ★★★很有帮助, 你有没有试过如果不加CTAB沉淀剂的情况下,能不能提出来总DNA? 2012-05-25 10:14:48
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 热心回帖,一起奖励EPI一枚~ 2012-05-26 10:52:51
mche2005: 金币+2, ★★★很有帮助, 你有没有试过如果不加CTAB沉淀剂的情况下,能不能提出来总DNA? 2012-05-25 10:14:48
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 热心回帖,一起奖励EPI一枚~ 2012-05-26 10:52:51
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给你一个我当时提DNA的详细步骤吧,有问题欢迎继续交流吧! 取50 mg 菌丝,加入液氮研磨成粉末状,加入600 µL CTAB 抽提液(2% CTAB,100 mmol Tris-HCl (pH 8.0),20 mmol EDTA,1.4 mol NaCl,pH 8.0,2% β-巯基乙醇)中,65℃温浴1 h。在抽提液中加入650 µL 氯仿-异戊醇(24﹕1),混匀后离心取上清,同法再抽提1遍。在上清中加入1 mL CTAB 沉淀液[1% CTAB,50 mmol Tris-HCl(pH 8.0),10 mmol EDTA],室温沉淀30 min,12 000 r/min 离心4 min,倒上清,将沉淀溶于 400 µL 高盐 TE[10 mmol Tris-HCl(pH 8.0),0.1 mmol EDTA,1 mol NaCl],37℃30 min 溶解。加入两倍体积-20℃无水乙醇在20℃沉淀2 h,12 000 r/min 离心5 min,风干后加入80 µL TE。取4 µL DNA 在1.5% 琼脂糖凝胶上电泳,剩余DNA-20℃保存备用. |
14楼2012-05-25 09:10:07
cxfans
铁杆木虫 (著名写手)
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2楼2012-05-23 11:32:52

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